2019年3月版の、在来線・新幹線表定速度ランキングを作ってみました。
一人でやっていることなので、誤りや勘違いなどもあるかもしれません。ご容赦ください。
最速は、やっぱり最終の上りのぞみです。昼間の東京－新大阪間ののぞみの平均的速度の向上などは、このランキングに反映されないので残念です。

（主なランキング）新幹線
1 のぞみ（64） 東海道・山陽新幹線 博多ー東京 4 :46 1069.1km 224.29km/h
2 みずほ613山陽・九州新幹線 新大阪ー鹿児島中央3 :41 810.5km 220.05km/h
3 のぞみ（95） 東海道・山陽新幹線 名古屋ー博多 3 :20 727.1km 218.13km/h
4 のぞみ（265） 東海道新幹線 東京ー新大阪 2 :22 515.4km 217.77km/h
5 はやぶさ（4） 東北新幹線 新青森ー東京 3 :6 674.9km 217.71km/h
6 はやぶさ（2,41） 東北新幹線 東京ー仙台 1 :31 325.4km 214.55km/h
7 はやぶさ5,11,38東北北海道 東京-新函館北斗 3 :58 823.7km 207.66km/h
8 さくら（567） 山陽九州 新大阪ー鹿児島中央 3 :58 810.5km 204.33km/h
9 とき（311） 上越新幹線 東京ー新潟 1 :37 300.8km 186.06km/h
10 かがやき（509,514） 北陸新幹線 東京ー金沢 2 :28 454.1km 184.09km/h
11 ひかり（多数） 東海道新幹線 東京ー新大阪 2 :53 515.4km 178.75km/h
12 はやぶさ（105,107,109）東北 東京ー盛岡 2 :48 496.5km 177.32km/h
13 こまち（6） 秋田新幹線 東京ー秋田 3 :35 623.8km 174.08km/h
14 つるぎ(719,723,731,733,724,734)北陸 富山ー金沢 0 :22 58.6km 159.82km/h
15 はやて(93) 東北北海道新幹線 盛岡－新函館北斗 2 :4 327.3km 158.37km/h
16 はくたか 北陸新幹線 東京ー金沢 2 :56 454.1km 154.81km/h
　(560,561,562,563,564,565,566,567,569)
17 やまびこ（41,60） 東北新幹線 東京ー盛岡 3 :15 496.5km 152.77km/h
18 つばめ（308） 九州新幹線 博多ー鹿児島中央 1 :46 256.8km 145.36km/h
19 はやて（91,100） 北海道 新青森ー新函館北斗 1 :2 148.8km 144.00km/h
20 あさま（605） 北陸新幹線 東京ー長野 1 :35 226km 142.74km/h
21 つばさ（124） 山形新幹線 東京ー山形 2 :27 342.2km 139.67km/h
22 なすの（258） 東北新幹線 東京ー郡山 1 :32 213.9km 139.50km/h
23 こだま（762） 山陽新幹線 新大阪ー博多 4 :0 553.7km 138.43km/h
24 たにかわ（321） 上越新幹線 東京ー越後湯沢 1 :20 182.7km 137.03km/h
25 なすの（269） 東北新幹線 東京ー那須塩原 1 :7 152.4km 136.48km/h
26 こだま（多数） 東海道新幹線 東京ー新大阪 3 :57 515.4km 130.48km/h
27 つばさ（131） 山形新幹線 東京ー新庄 3 :11 403.7km 126.82km/h
28 つばめ（317,312,330.332）九州 博多－熊本 0 :48 98.2km 122.75km/h

在来線（上位20位まで）
順位 種別 列車名 走行区間 時間 分 走行キロ 表定速度
1 特急 サンダーバード（9,10号） 大阪ー金沢 2 :34 267.6km 104.26km/h
2 特急 ソニック（17,26,30号） 博多ー大分 2 :1 198.5km 98.43km/h
3 特急 ダイナスター（1,3,4号） 福井ー金沢 0 :47 76.7km 97.91km/h
4 特急 ライラック 札幌ー旭川 1 :25 136.8km 96.56km/h
5 特急 カムイ 札幌ー旭川 1 :25 136.8km 96.56km/h
6 特急 しらさぎ（65号） 米原ー金沢 1 :51 176.6km 95.46km/h
7 特急 おはようエクスプレス 敦賀－金沢 1 :23 130.7km 94.48km/h
8 特急 あずさ（12） 松本ー新宿 2 :23 225.1km 94.45km/h
9 特急 ひたち（7号） 品川ーいわき 2 :22 222km 93.80km/h
10 （参考） こまち在来線区間（39） 秋田ー盛岡 1 :23 127.3km 92.02km/h
11 特急 スーパー北斗（２） 札幌ー函館 3 :29 318.7km 91.49km/h
12 特急 近鉄　名阪甲特急（平日65） 名古屋ー難波 2 :5 189.7km 91.06km/h
13 特急 おやすみエクスプレス 金沢ー福井 1 :27 130.7km 90.14km/h
14 特急 ときわ（55号） 上野ー勝田 1 :23 123.3km 89.13km/h
15 超快速 スノーラビット（下） 越後湯沢ー直江津 0 :57 84.2km 88.63km/h
16 特急 すずらん（3,6） 札幌-東室蘭 1 :28 129.2km 88.09km/h
17 特急 らくラクはりま（上り） 姫路ー大阪 1 :0 87.9km 87.90km/h
18 特急 スーパーおおぞら（12） 釧路ー札幌 3 :58 348.5km 87.86km/h
19 特急 近鉄　しまかぜ（下り） 難波ー賢島 2 :1 176.9km 87.72km/h
20 特急 スカイライナー 京成上野ー成田空港 0 :44 64.1km 87.41km/h

noteでは表組みが出来ないため、一覧表形式をPDFで作ってみました。
こちらは、新幹線全部と、JR在来線の特急、主な私鉄の特急・急行列車・観光列車・SL牽引列車などを307位まで並べてみました。「なぜあの列車が入っていない！」といったことがあるかもしれませんが、多分それは、単なる私の見落としです。あと、間違えているところもあるかもしれません。何分一人でやっていることゆえ、ご容赦願います。

新幹線版PDF

在来線版PDF

どうぞよろしくお願いいたします。