# 今どれくらい使ってるのか確認する
$ docker system df
TYPE                TOTAL               ACTIVE              SIZE                RECLAIMABLE
Images              1                   1                   97.67MB             0B (0%)
Containers          1                   1                   0B                  0B
Local Volumes       1                   1                   1.875MB             0B (0%)
Build Cache         0                   0                   0B                  0B

# -v を付けると項目ごとの情報を確認できる
$ docker system df -v

# 未使用ファイルを削除する
$ docker system prune
WARNING! This will remove:
       - all stopped containers
       - all networks not used by at least one container
       - all dangling images
       - all dangling build cache
Are you sure you want to continue? [y/N] y
Total reclaimed space: 12345B
$

# 未使用のLocal Volumeを削除する場合はこれ
$ docker volume prune

ログのローテートは以下が分かりやすい。
Dockerのログのクリア方法とローテーション設定について