社会的マイクロバイオームにおける微生物伝播と宿主の健康と疾患

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遠近法|2024年1月4日、第187巻第1号、p17-43

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社会的マイクロバイオームにおける微生物伝播と宿主の健康と疾患

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アマール・サルカール
キャメロン・J.A.・マッキンロイ
シボーン・ハーティ
ユージン・V・クーニン
レイチェル・N・カーモディ 21
アンドリュー・H・モーラー 21
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脚注を表示するDOI:https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.12.014

要旨
社会的相互作用は病原体の伝播を促進することが知られているが、社会的に伝播される宿主に関連した相互扶助者や通性微生物の宿主の健康や疾患への寄与については、まだ十分に解明されていない。我々は、社会的マイクロバイオーム(宿主の社会的ネットワークに存在する微生物のメタコミュニティ)の概念を用いて、宿主の健康と疾患に対する社会的微生物伝播の意味を分析する。生態進化的マイクロバイオームコミュニティプロセス(コロニー形成抵抗性、病原性の進化、生態学的撹乱に対する反応)と、微生物伝播に基づくプロセス(代謝・免疫効果を持つ微生物の伝播、種間伝播、抗生物質耐性微生物の伝播、ウイルスの伝播)の両方に対する社会的伝播微生物の寄与を調査する。我々は、伝染性疾患と非伝染性疾患に対する社会的微生物伝播の意味を考察し、定型的な非伝染性疾患の根底にある社会的伝播要素の重要性を評価する。相互扶助者と通性微生物の社会的伝播は、健康の社会的決定要因において重要かつ過小評価された役割を果たし、社会進化における隠れた力として作用する可能性がある。
キーワード
微生物伝播
社会的伝播
微生物叢
健康の社会的決定要因
社会進化
免疫
社会的ネットワーク
抗生物質
抗生物質耐性
社会的ビローム
感染症
非感染性疾患
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Cell Host Microbe. 2023; 31: 554-570
論文で見る
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ミューラー N.T.
バカックス E.
コンベリックJ.
グリゴリアンZ.
ドミンゲス-ベロM.G.
乳児マイクロバイオームの発達: ママの問題。
トレンドMol。Med. 2015; 21: 109-117
論文で見る
スコープス (631)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ワネリック K.M.
ラウロ A.
トロイツキーT.
ハスビー A.
ノウルズ S.C.L.
野生マウスにおける腸内細菌叢の形成過程において、母性伝播は社会伝播に道を譲る。
動物。Microbiome. 2023; 5: 29
論文で見る
スコープス (1)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
モーラー A.H.
鈴木 T.A.
ファイファー-リキシーM.
ナックマンM.W.
哺乳類腸内細菌叢の伝播様式。
Science. 2018; 362: 453-457
論文で見る
スコープス (154)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マゼル F.
ギザンA.
パルフリーL.W.
哺乳類の腸内微生物における伝播様式と分散形質は宿主特異性と相関する。
Mol. Ecol. 2023;
https://doi.org/10.1111/mec.16862
論文で見る
スコープス (3)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ヒルデブランド F.
ゴスマンT.I.
フリウー C.
エズクルトE.
マイヤーズ P.N.
フェレッティ P.
クーン M.
バフラム M.
ニールセン H.B.
ボーク P.
分散戦略は、ヒト腸内細菌の持続性と進化を形成する。
Cell Host Microbe. 2021; 29: 1167-1176
論文で見る
スコープス (45)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ラウロ A.
ルオコライネン L.
レーン A.
アマト K.
ナイト R.
リー S.
スタンプフ R.
ホワイト B.
ネルソン K.E.
バーデン A.L.
テコット S.R.
アカハラキツネザル(Eulemur rubriventer)の社会行動と腸内細菌叢: 社会性の進化における免疫の役割を探る。
J. Anim. Ecol. 2018; 87: 388-399
論文で見る
スコープス (47)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ジョンソンK.V.-A.
腸内細菌叢の組成と多様性はヒトの性格特性と関連している。
Hum. Microb. J. 2020; 15100069
論文で見る
スコープス (104)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
レーン A.A.
マクガイア M.K.
マクガイア M.A.
ウィリアムズ J.E.
ラッキー K.A.
ハーゲン E.H.
コール A.
ギンドラ D.
ゲベエフ D.
フローレス K.E.

世帯構成と乳児の糞便マイクロバイオーム: INSPIRE研究。
Am. J. Phys. Anthropol. 2019; 169: 526-539
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
スチュワート C.J.
アジャミ N.J.
オブライエンJ.L.
ハッチンソン D.S.
スミス D.P.
ウォン M.C.
ロス M.C.
ロイド R.E.
ドダパネニ H.
メトカーフG.A.
他。
TEDDY研究による幼児期における腸内細菌叢の時間的発達。
Nature. 2018; 562: 583-588
論文で見る
スコープス (979)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ラックス S.
スミス D.P.
ハンプトン-マーセルJ.
オーウェンズ S.M.
ハンドリー K.M.
スコット N.M.
ギボンズ S.M.
ラーセン P.
ショーガン B.D.
ワイス S.
他。
ヒトと室内環境における微生物相互作用の経時的解析。
Science. 2014; 345: 1048-1052
論文で見る
スコープス (609)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シュミット T.S.
ヘイワード M.R.
コエリョL.P.
リー S.S.
コステア P.I.
ヴォイト A.Y.
ヴィルベル J.
マイストレンコ O.M.
アルヴェス R.J.
ベルクステンE.
ら。
消化管に沿った微生物の広範な伝播。
eLife. 2019; 8e42693
記事で見る
スコープス(251)
クロスライフ
グーグル奨学生
チャン X.
Zhang D.
Jia H.
Feng Q.
Wang D.
Liang D.
ウー X.
Li J.
Tang L.
Li Y.
et al.
関節リウマチでは口腔内および腸内細菌叢が障害され、治療後に一部正常化する。
Nat. Med. 2015; 21: 895-905
論文で見る
スコープス (1070)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ゲバース D.
クガタサンS.
デンソンL.A.
バスケス=バエサ Y.
Van Treuren W.
レン B.
シュワガー E.
ナイツ D.
ソン S.J.
ヤスールM.
他。
新規発症クローン病における治療歴のないマイクロバイオーム。
Cell Host Microbe. 2014; 15: 382-392
論文で見る
スコープス (2137)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
アマト K.R.
アリエッタ M.-C.
アザド M.B.
ベイリー M.T.
ブルサードJ.L.
ブルゲリング C.E.
クラウド E.C.
コステロ E.K.
ダベンポート E.R.
デュティルB.E.

ヒト腸内細菌叢と健康格差。
Proc. Natl. Sci. USA. 2021; 118e2017947118
論文で見る
スコープス (66)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ルックG.
ベッケドF.
レヴィン B.R.
マクフォール・ンガイ M.J.
マクリーン A.R.
進化、ヒトと微生物の相互作用、および生活史の可塑性。
Lancet. 2017; 390: 521-530
論文で見る
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
バフィーC.G.
パマー E.G.
腸内病原体に対する微生物叢を介したコロニー形成抵抗性。
Nat. Rev. Immunol. 2013; 13: 790-801
論文で見る
スコパス (940)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
カバジェロ-フローレスG.
ピカードJ.M.
ヌニェスG.
微生物叢を介したコロニー形成抵抗性:そのメカニズムと制御。
Nat. Rev. Microbiol. 2023; 21: 347-360
論文で見る
スコパス (0)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
橋本 D.
ミラーJ.
メラドM.
生体内における樹状細胞とマクロファージの不均一性。
Immunity. 2011; 35: 323-335
論文で見る
スコープス(313)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
カミングス J.H.
マクファーレンG.T.
栄養代謝における腸内細菌の役割。
J. Parenter. 1997; 21: 357-365
記事で見る
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ロズポーンC.A.
ストンボーJ.I.
ゴードンJ.I.
ヤンソンJ.K.
ナイトR.
ヒト腸内細菌叢の多様性、安定性、回復力。
Nature. 2012; 489: 220-230
論文で見る
スコープス(3440)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
百瀬雄一郎
平山和久
伊藤和彦
乳児腸内細菌叢に関連した大腸菌O157:H7コロニー形成の抑制に対する有機酸の効果。
Antonie Leeuwenhoek. 2008; 93: 141-149
論文で見る
(0件)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ファビッチ A.J.
ジョーンズ S.A.
チョードリー F.Z.
チェルノセック A.
アンダーソン A.
スモーリー D.
マクハーグJ.W.
ハイタワーG.A.
スミス J.T.
オーティエリ S.M.

マウス腸内における病原性大腸菌と常在性大腸菌の炭素栄養の比較。
Infect. Immun. 2008; 76: 1143-1152
論文で見る
スコープス (277)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
スプラッゲF.
バッケレンE.
ヤーン M.T.
アラウージョ E.B.N.
ピアソン C.F.
ワン X.
パンクハースト L.
クンラス O.
フォスター K.R.
マイクロバイオームの多様性は、栄養ブロックによって病原体から身を守る。
Science. 2023; 382: EADJ3502
論文で見る
スコープス (0)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
カバジェロ-フローレスG.
ピカード J.M.
福田真一
井ノ原直彦
ヌニェスG.
腸内におけるアミノ酸の競合を回避することで、コロニー形成抵抗性を覆す腸内病原体。
Cell Host Microbe. 2020; 28: 526-533
論文で見る
スコパス (19)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
福田真一
トウ・エイチ
長谷和彦
大島和彦
中西康之
吉村和彦
戸部 徹
クラーク J.M.
トッピング D.L.
鈴木 T.

ビフィズス菌は酢酸産生により腸管病原体感染から身を守る。
Nature. 2011; 469: 543-547
論文で見る
日本経済新聞
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ローリーT.D.
ウォーカーA.W.
腸管コロニー形成抵抗性。
Immunology. 2013; 138: 1-11
論文で見る
スコープス (390)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
レバインJ.M.
ダントニオ C.M.
エルトン再訪: 多様性と侵略性を結びつける証拠のレビュー。
Oikos. 1999; 87: 15-26
記事で見る
クロスリファレンス
グーグル・スカラー
キム・S.
コビントン A.
パマー E.G.
腸内細菌叢: 抗生物質、コロニー形成抵抗性、腸内病原体。
Immunol. Rev. 2017; 279: 90-105
論文で見る
スコープス (424)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リース A.T.
ダン R.R.
マイクロバイオーム生物多様性の原動力: 一般的なルール、糞便、無知についてのレビュー。
mBio. 2018; 9e01294-18
論文で見る
スコープス (187)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
クレッソン M.J.
ジェフェリー I.B.
コンデS.
パワーS.E.
オコナー E.M.
キューザック S.
ハリス H.M.B.
コークリー M.
ラクシュミナラヤナン B.
オサリバンO.
他。
腸内細菌叢組成は高齢者の食事と健康に相関する。
Nature. 2012; 488: 178-184
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ロズポーンC.A.
Li M.
キャンベル T.B.
フローレス S.C.
リンダマン D.
ゲベール M.J.
ナイト R.
フォンテA.P.
パーマーB.E.
HIV-1感染に伴う腸内細菌叢の変化。
Cell Host Microbe. 2013; 14: 329-339
論文で見る
スコープス (320)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
ジョンソン K.V.-A.
バーネットP.W.J.
マイクロバイオーム:多様性から多様化すべきか?
Gut Microb. 2016; 7: 455-458
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
タイス C.A.
イターヴS.
ロスチャイルドD.
メイジャー M.T.
レヴィ M.
モレシ C.
ドハナロヴァ L.
ブラヴァーマン S.
ロジン S.
マリツキーS.
ら。
持続的なマイクロバイオームの変化は、ダイエット後の体重増加率を調節する。
Nature. 2016; 540: 544-551
論文で見る
スコープス (327)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
スミス P.
ウィレムセンD.
ポプケスM.
メッジ F.
ガンディワ E.
ライチャード M.
ヴァレンツァーノD.R.
短命なアフリカツメダカにおける腸内細菌叢による寿命制御。
eLife. 2017; 6e27014
論文で見る
スコープス(247)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
Jiang H.
Ling Z.
Zhang Y.
Mao H.
Ma Z.
Yin Y.
Wang W.
Tang W.
タン Z.
Shi J.
et al.
大うつ病性障害患者における糞便微生物叢組成の変化。
Brain Behav. Immun. 2015; 48: 186-194
論文で見る
スコープス (1422)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ウェルドン L.
アボリンズS.
レンジL.
ボーン C.
ライリー E.M.
ヴィニーM.
野生マウスの腸内細菌叢。
PLoS One. 2015; 10e0134643
論文で見る
スコープス(80)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ファウ M.
デグレゴリS.
ジョンソンG.
テネンバウム S.R.
バーバー P.H.
フィルソン C.S.
ブルムスタイン D.T.
社会的マイクロバイオーム: 腸内細菌叢の多様性と存在量は、野生哺乳類の社会性と負の相関がある。
R. Soc. Open Sci.
論文で見る
スコパス(1)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ラハティ L.
サロヤルヴィJ.
サロネン A.
シェファー M.
デ・ヴォスW.M.
ヒト腸内生態系における転倒要素。
Nat. Commun. 2014; 5: 4344
論文で見る
スコープス (183)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ザネベルトJ.R.
マクマインズR.
ベガ・サーバーR.
ストレスと安定性: アンナ・カレーニナの原理を動物マイクロバイオームに応用。
Nat. Microbiol. 2017; 2: 17121
論文で見る
スコープス (460)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デイ P.
レイ・チャウドゥリ S.
腸内常在細菌叢の日和見的性質。
Crit。Rev. Microbiol. 2023; 49: 739-763
論文で見る
スコパス (7)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ユーマンス B.P.
アジャミ N.J.
ジアン Z.-D.
キャンベル F.
ワズワース W.D.
ペトロシーノ・J.F.
デュポン H.L.
ハイランダー S.K.
旅行者下痢症におけるヒト腸内細菌叢の特性化。
Gut Microb. 2015; 6: 110-119
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ビョーク J.R.
Dasari M.
グリーネセンL.
アーチー E.A.
霊長類のマイクロバイオームの経時的変化: マイクロバイオーム研究における常設質問への縦断的回答。
Am. J. Primatol. 2019; 81e22970
論文で見る
スコープス(36)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ペロフスキー A.C.
アンセル・メイヤーズL.
アボンダーノL.A.
ディ・フィオーレA.
ルイス R.J.
社会集団が野生シファカ腸内細菌叢の時空間ダイナミクスを制約している。
Mol. Ecol. 2021; 30: 6759-6775
論文で見る
スコパス (13)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Zhao Q.
エルソンC.O.
腸内細菌抗原による適応免疫教育。
Immunology. 2018; 154: 28-37
論文で見る
スコープス (160)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
フェング T.
エルソンC.O.
宿主と微生物叢の対話における適応免疫。
Mucosal Immunol. 2011; 4: 15-21
論文で見る
麹菌 (0)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
Amato K.R.
ヒトおよびヒト以外の霊長類の生態と進化のモデルに腸内細菌叢を組み込む。
Am. J. Phys. Anthropol. 2016; 159: 196-215
論文で見る
スコープス (54)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
グリネイゼン L.E.
シャルパンティエM.J.E.
アルバーツ S.C.
ブレクマンR.
ブラッドバードG.
トゥン J.
アーチー E.A.
遺伝子、地質学、そして細菌: 霊長類のハイブリッドゾーンにおける腸内細菌叢は、宿主種ではなく、その土地の土壌特性によって説明される。
Proc. Biol. Sci. 2019; 28620190431
論文で見る
グーグル・スカラー
エワルド P.W.
寄生-相互主義連続体の伝達様式と進化。
Ann. N. Y. Acad. 1987; 503: 295-306
論文で見る
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
スチュワート A.D.
ログスドンJ.M.
ケリー S.E.
水平感染と垂直感染における病原性の進化に関する実証的研究。
Evolution. 2005; 59: 730-739
論文で見る
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
フォスター K.R.
シュルーターJ.
コイト K.Z.
ラコフ-ナホウムS.
鎖につながれた生態系としての宿主マイクロバイオームの進化。
Nature. 2017; 548: 43-51
論文で見る
スコープス (481)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リプシッチ M.
シラーS.
ノワック M.A.
垂直伝播および水平伝播を伴う病原体における病原性の進化。
Evolution. 1996; 50: 1729-1741
論文で見る
PubMed
クロスレフ
グーグル奨学生
エベルト D.
ブル J.J.
病原性の進化に関するトレードオフモデルへの挑戦: 病原性管理は可能か?
Trends Microbiol. 2003; 11: 15-20
論文で見る
スコパス (0)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ホイトJ.R.
ラングウィッグ K.E.
ホワイトJ.P.
カーラッカ H.M.
レデル J.A.
クルタ A.
デピュー J.E.
スカロン W.H.
パリーゼ K.L.
フォスターJ.T.

病原体のコミュニティネットワークにおける伝播の謎に迫る。
Nature. 2018; 563: 710-713
論文で見る
スコパス (39)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ブラウン H.P.
フォースター S.C.
アノニェ B.O.
クマール N.
ネビル B.A.
スターズ M.D.
グールディング D.
ローリーT.D.
培養不可能な」ヒト微生物叢の培養により、新規分類群と広範な胞子形成が明らかになった。
Nature. 2016; 533: 543-546
論文で見る
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
デール V.H.
ジョイス L.A.
マクナルティ S.
ニールソン R.P.
エアーズM.P.
フラニガン M.D.
ハンソン P.J.
アイランド L.C.
ルーゴ A.E.
ピーターソンC.J.

気候変動と森林攪乱:気候変動は、火災、干ばつ、外来種、昆虫・病原菌の発生、ハリケーン、暴風雨、氷嵐、地滑りなどの頻度、強度、期間、タイミングを変化させることで森林に影響を与える可能性がある。
Bioscience. 2001; 51: 723-734
記事で見る
スコープス (0)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ガンダーソン L.H.
生態学的回復力-理論と応用。
Annu. Rev. Ecol. Syst. 2000; 31: 425-439
論文で見る
スコパス (1774)
クロスリファレンス
グーグル・スカラー
デ・ニーズL.
コブラスC.M.
Stracy M.
抗生物質が誘発する微生物叢の付随的損傷と関連感染症。
Nat. Rev. Microbiol. 2023; 21: 789-804
論文で見る
スコープス (1)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ヘーガン T.
コルテーゼM.
ルーファエル N.
ブードロー C.
リンデ C.
マドゥール M.S.
ダス J.
ワン H.
グートミラーJ.
鄭N.-Y.
他。
抗生物質による腸内細菌叢の擾乱は、ヒトのワクチンに対する免疫を変化させる。
Cell. 2019; 178: 1313-1328
論文で見る
スコープス (334)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
イェルンベリ C.
ロフマルク S.
エドランド C.
ヤンソンJ.K.
抗生物質投与がヒト腸内細菌叢に及ぼす長期的生態学的影響。
ISME J. 2007; 1: 56-66
論文で見る
スコープス (770)
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
ヤコブソン H.E.
ヤーンベリC.
アンデルソン A.F.
Sjölund-Karlsson M.
ヤンソン J.K.
Engstrand L.
短期間の抗生物質投与がヒトの喉と腸内細菌叢に与える長期的影響は異なる。
PLoS One. 2010; 5e9836
論文で見る
スコープス (839)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
デスレフセン L.
レルマンD.A.
抗生物質の反復擾乱に対するヒト遠位腸内細菌叢の不完全な回復と個体差反応。
Proc. Natl. Sci. USA. 2011; 108: 4554-4561
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
パレヤA.
ミケルセン K.H.
Forslund S.K.
カシャニ A.
アリン K.H.
ニールセン T.
ハンセン T.H.
Liang S.
Feng Q.
Zhang C.
et al.
抗生物質曝露後の健康成人の腸内細菌叢の回復。
Nat. Microbiol. 2018; 3: 1255-1265
論文で見る
スコープス (379)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
木村伊量
宮本 淳
大植・北野倫子
渡辺和彦
山田哲也
大貫雅之
青木理恵子
磯部祐子
樫原大輔
井上大介
et al.
妊娠中の母親の腸内細菌叢はマウスの子孫の代謝表現型に影響する。
Science. 2020; 367eaaw8429
論文で見る
スコープス (56)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デスレフセンL.
ヒューズS.
ソギン M.L.
レルマンD.A.
ヒトの腸内細菌叢に及ぼす抗生物質の広範な影響、16S rRNAのディープシークエンシングにより明らかに。
PLoS Biol.
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
レイマン K.
シェイファーZ.
モラン N.A.
抗生物質曝露は腸内細菌叢を擾乱し、ミツバチの死亡率を上昇させる。
PLoS Biol.
論文で見る
スコープス(297)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
リース A.T.
チョー E.H.
クリッツマンB.
ニコルズ S.P.
Wisniewski N.A.
ヴィラ M.M.
デュラン H.K.
ジアン S.
ミダニ F.S.
ニンマガッダ S.N.

抗生物質が誘発する微生物叢の変化が、腸内の酸化還元動態を乱す。
eLife. 2018; 7e35987
論文で見る
スコープス (98)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ン K.M.
アランダ-ディアスA.
トロピーニ C.
フランケル M.R.
Van Treuren W.
オローリン C.T.
メリル・B.D.
ユー F.B.
プルース K.M.
オリベイラ R.A.

抗生物質投与後の腸内細菌叢の回復は、宿主の食事、コミュニティーの状況、環境リザーバーに依存する。
Cell Host Microbe. 2019; 26: 650-665
論文で見る
スコープス (117)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
クラベル T.
ルパージュ P.
シャリエ C.
コリオバクテリウム科
で: Rosenberg E. DeLong E.F. Lory S. Stackebrandt E. Thompson F. 原核生物: 原核生物:放線菌。シュプリンガー, 2014: 201-238
論文で見る
スコープス (100)
クロスリファレンス
グーグル学者
マルティン R.
リオス-コヴィアンD.
ユイレ E.
オージェ S.
カザール S.
ベルムデス-フマランL.G.
ソコル H.
シャテル J.-M.
ランジェラ P.
フェカリバクテリウム: ヒトの健康への応用が期待される細菌属。
FEMS Microbiol. Rev. 2023; 47: fuad039
論文で見る
スコパス (5)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
オキャラハン A.
ファン・シンデレンD.
ビフィズス菌とヒト腸内細菌叢のメンバーとしての役割。
Front. Microbiol. 2016; 7: 925
論文で見る
スコープス (580)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
コールK.D.
ステンゲルA.
デアリング M.D.
新規宿主にタンニン分解細菌を接種すると、タンニンを多く含む飼料での成績が向上する。
Environ. Microbiol. 2016; 18: 1720-1729
論文で見る
スコープス (57)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マギル S.S.
エドワーズJ.R.
バンベルクW.
ベルダブス Z.G.
ドゥミアティ G.
ケイナー M.A.
リンフィールド・R.
マロニーM.
マカリスター・ホロッドL.
ナドルJ.
他。
医療関連感染症の多施設共同有病率調査。
N. Engl. J. Med. 2014; 370: 1198-1208
論文で見る
スコープス (2740)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ジョンソン K.V.-A.
ワトソンK.K.
ダンバー R.I.M.
バーネット P.W.J.
非適応的なサル集団における社交性は、有益な腸内細菌と関連している。
Front. Microbiol. 2022; 13: 1032495
論文で見る
スコパス (4)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
サルカー A.
ハーティーS.
モーラー A.H.
クライン S.L.
エドマン S.E.
フリストン K.J.
カーモディ R.N.
SARS-CoV-2に対する感受性差のバイオマーカーとしての腸内細菌叢。
Trends Mol. Med. 2021; 27: 1115-1134
論文で見る
スコープス (0)
パブコメ
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
リー・N.
マー W.-T.
Pang M.
ファン Q.-L.
Hua J.-L.
常在細菌叢とウイルス感染: 包括的レビュー。
Front. Immunol. 2019; 10: 1551
論文で見る
スコープス (172)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
古沢由美子
小畑由美子
福田真一
遠藤利明
中藤剛志
高橋大輔
中西義人
植竹 C.
加藤和彦
加藤貴之

腸内細菌由来の酪酸は大腸制御性T細胞の分化を誘導する。
Nature. 2013; 504: 446-450
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
スミス P.M.
ハウィット M.R.
パニコフN.
ミショー M.
ガリーニ C.A.
Bohlooly-Y M.
グリックマン J.N.
ギャレット W.S.
微生物の代謝産物である短鎖脂肪酸は、大腸Treg細胞の恒常性を制御する。
Science. 2013; 341: 569-573
論文で見る
日本経済新聞
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ゲバ-ザトルスキーN.
セフィクE.
クアL.
パスマンL.
タン・T.G.
オルティス-ロペスA.
ヤノーツァン T.B.
ヤン・L.
ジュップ R.
マティスD.
他。
ヒト腸内細菌叢から免疫調節生物を探索。
Cell. 2017; 168: 928-943
論文で見る
スコープス (490)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
シュルーターJ.
ペレドJ.U.
テイラー B.P.
マーキー K.A.
スミス M.
タウル Y.
ニーフス R.
スタファス A.
ダイ A.
フォンタナ E.
et al.
腸内細菌叢はヒトの免疫細胞動態と関連している。
Nature. 2020; 588: 303-307
論文で見る
スコープス (212)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ポラス A.M.
Shi Q.
Zhou H.
カラハン R.
モンテネグロ・ベサンクールG.
ソロモンズ N.
ブリトー I.L.
腸内細菌叢組成の地理的差は腸内感染感受性に影響する。
Cell Rep.
論文で見る
スコパス (20)
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
マズマニアン S.K.
ラウンドJ.L.
カスパー D.L.
微生物共生因子が腸炎症性疾患を予防する。
Nature. 2008; 453: 620-625
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロス
グーグル奨学生
アタラシ K.
田之上貴之
大島和彦
須田和彦
永野祐子
西川博之
福田 聡
齋藤知行
成嶋慎太郎
長谷和彦
他。
ヒト微生物叢から合理的に選択されたクロストリジウム菌株の混合物によるTreg誘導。
Nature. 2013; 500: 232-236
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
フェイスJ.J.
アハーンP.P.
リダウラ V.K.
チェン J.
ゴードン J.I.
同腹仔マウスのコンビナトリアルコミュニティを用いた腸内微生物と宿主の表現型関係の同定。
Sci. Transl. Med. 2014; 6: 220ra11
論文で見る
スコープス (281)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ダスグプタ S.
エルトゥルク・ハスデミルD.
オチョア-レパラズJ.
ライネッカー H.-C.
カスパー D.L.
形質細胞様樹状細胞は、腸内常在分子に対する抗炎症応答を、生得的および適応的メカニズムによって媒介する。
Cell Host Microbe. 2014; 15: 413-423
論文で見る
スコープス (213)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
An D.
オー S.F.
オルザック T.
ネヴェス J.F.
Avci F.Y.
Erturk-Hasdemir D.
ルー X.
ツァイシグ S.
ブルムバーグ R.S.
カスパー D.L.
共生微生物由来のスフィンゴ糖脂質が宿主腸管ナチュラルキラーT細胞のホメオスタシスを制御する。
Cell. 2014; 156: 123-133
論文で見る
スコパス (432)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
キム S.
Kim H.
Yim Y.S.
ハ S.
Atarashi K.
タン T.G.
ロングマン R.S.
ホンダ K.
リットマン D.R.
チェ G.B.
許 J.R.
母親の腸内細菌がマウスの子供の神経発達異常を促進する。
Nature. 2017; 549: 528-532
論文で見る
スコープス (409)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
イワノフ I.I.
アタラシ K.
マネル N.
ブロディ E.L.
嶋 T.
カラオズ U.
ウェイ D.
ゴールドファーブ K.C.
サンティー C.A.
リンチ S.V.
他。
分節した糸状菌による腸管Th17細胞の誘導。
Cell. 2009; 139: 485-498
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ヴァイシュナヴァ S.
山本幹男
セバーソン K.M.
ルーン K.A.
ユー X.
コレン O.
レイ・R.
ウェイクランド E.K.
フーパー L.V.
抗菌レクチンRegIIIγは腸内で微生物叢と宿主の空間的分離を促進する。
Science. 2011; 334: 255-258
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
佐野利明
黄 W.
ホール J.A.
ヤン Y.
チェン A.
ガブジー S.J.
リー J.-Y.
ジール J.W.
ミラルディ E.R.
ドミンゴス A.I.

IL-23R/IL-22回路が上皮血清アミロイドAを制御し、局所エフェクターTh17応答を促進する。
Cell. 2015; 163: 381-393
論文で見る
スコープス (395)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
マクファーソン A.J.
ウールT.
常在細菌を保有する腸管樹状細胞による防御的IgAの誘導。
Science. 2004; 303: 1662-1665
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ペディコードV.A.
ロックハートA.A.K.
ランガン K.J.
クレイグ J.W.
ロシュコ J.
ロゴス A.
ハング H.C.
ムチダD.
腸管バリア機能と腸内病原体耐性を促進するための宿主-宿主間相互作用の利用。
Sci. Immunol. 2016; 1eaai7732
論文で見る
スコープス (51)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ランガン K.J.
ペディコードV.A.
ワン Y.-C.
Kim B.
ルー Y.
シャハム S.
ムチダ D.
ハング H.C.
分泌型ペプチドグリカンヒドロラーゼは腸内病原体に対する耐性を増強する。
Science. 2016; 353: 1434-1437
論文で見る
スコープス (94)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
セフィク E.
ゲバ-ザトルスキーN.
オー・S.
Konnikova L.
ゼムールD.
マクガイアA.M.
ブルジンD.
オルティス-ロペスA.
ロベラ M.
ヤンJ.
他。
個々の腸内共生生物は、RORγ+制御性T細胞の別個の集団を誘導する。
Science. 2015; 349: 993-997
論文で見る
スコープス (601)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ルティ B.
ル・シャトリエE.
デローザL.
ドゥオン C.P.M.
Alou M.T.
ダイエール R.
フルッキガー A.
メッサウデネ M.
ラウバー C.
ロベルティ M.P.

上皮性腫瘍に対するPD-1ベースの免疫療法の有効性に腸内細菌叢が影響する。
Science. 2018; 359: 91-97
論文で見る
スコープス (3219)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マトソンV.
フェスラーJ.
バオ R.
チョンスワットT.
Zha Y.
アレグレ M.-L.
ルーク J.J.
ガジェフスキー T.F.
常在細菌叢は転移性黒色腫患者における抗PD-1効果と関連している。
Science. 2018; 359: 104-108
論文で見る
スコープス (1779)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ゴパラクリシュナンV.
スペンサーC.N.
ネジ・L.
ルーベン A.
アンドリュース M.C.
カルピネッツT.V.
プリエト P.A.
ビセンテ D.
ホフマン K.
ウェイ S.C.
et al.
腸内細菌叢はメラノーマ患者の抗PD-1免疫療法に対する反応を調節する。
Science. 2018; 359: 97-103
論文で見る
スコープス (2723)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
グリフィン M.E.
エスピノーサJ.
ベッカーJ.L.
ルオ J.-D.
キャロル T.S.
Jha J.K.
ファンガーG.R.
ハング H.C.
腸球菌のペプチドグリカンリモデリングはチェックポイント阻害剤のがん免疫療法を促進する。
Science. 2021; 373: 1040-1046
論文で見る
スコープス(117)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ラム K.C.
アラヤ R.E.
Huang A.
チェン Q.
ディ・モディカ M.
ロドリゲス R.R.
ロペス A.
ジョンソン S.B.
シュワルツ B.
ボーレンセン E.
et al.
微生物叢は、STING-type I IFN依存的な腫瘍微小環境の単球リプログラミングを誘発する。
Cell. 2021; 184: 5338-5356
論文で見る
スコープス (174)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
ブラントン L.V.
シャルボノー M.R.
サリフ T.
バラット M.J.
ヴェンカテッシュ S.
イルカベヤO.
スブラマニアン S.
マナリー・M.J.
トレハン I.
ヨルゲンセン J.M.

栄養失調児の微生物叢から伝達される成長障害を予防する腸内細菌。
Science. 2016; 351: aad3311
論文で見る
スコープス (486)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
パク J.S.
ガザニガ F.S.
ウー M.
ルーセンズ A.K.
ギリス J.
鄭 W.
ラフルール M.W.
ジョンソン S.B.
モラド G.
パークE.M.
他。
PD-L2-RGMbを標的とすることで、微生物に関連した免疫療法抵抗性が克服された。
Nature. 2023; 617: 377-385
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マガーL.F.
ブルクハルトR.
ペットN.
クック N.C.A.
ブラウン K.
ラメイ H.
パイク S.
スタッグ J.
グローブス R.A.
ギャロ M.
他。
微生物由来のイノシンはチェックポイント阻害剤免疫療法に対する反応を調節する。
Science. 2020; 369: 1481-1489
論文で見る
PubMed
クロスレビュー
グーグル奨学生
ハリス V.C.
アルマーG.
フエンテスS.
コルペラ K.E.
パラシャール U.
ビクター J.C.
テイト J.
デ・ウィースC.
ジアキント C.
Wiersinga W.J.
et al.
ガーナ農村部における乳児の腸内マイクロバイオームとロタウイルスワクチン反応との有意な相関。
J. Infect. Dis. 2017; 215: 34-41
論文で見る
スコープス (208)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
マイニ・レクダルV.
ベスE.N.
ビサンズJ.E.
ターンボー P.J.
バルスカス E.P.
レボドパ代謝のための種間腸内細菌経路の発見と阻害。
Science. 2019; 364eaau6323
論文で見る
スコパス (378)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ハイザー H.J.
グーテンバーグD.B.
チャットマンK.
シラサニ G.
バルスカス E.P.
ターンボー P.J.
ヒト腸内細菌Eggerthella lentaによる心筋薬剤不活性化の予測と操作。
Science. 2013; 341: 295-298
論文で見る
スコープス(460)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
クリュネマン M.
アンドレイエフS.
ブラッシェS.
マテウス A.
ファパレP.
デベンドラン S.
ヴァッピアーニ J.
サイモン B.
スコット T.A.
カフキアE.
他。
ヒト腸内細菌による治療薬の生物濃縮。
Nature. 2021; 597: 533-538
論文で見る
スコープス(128)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
ディラード B.A.
チョン A.K.
ガンダーソンA.R.
キャンベル・スタトン S.C.
モーラー A.H.
都市環境における野生動物の腸内細菌叢のヒト化。
eLife. 2022; 11e76381
論文で見る
スコープス (12)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
エリス R.J.
ブルース・K.D.
ジェンキンス C.
ストサードJ.R.
アジャロバ L.
ムギシャ・L.
ヴィニーM.E.
アフリカにおける人と動物の遠位腸内細菌叢の比較。
PLoS One. 2013; 8e54783
論文で見る
スコープス (56)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ウルフ N.D.
デュナヴァンC.P.
ダイヤモンドJ.
主要なヒト感染症の起源。
Nature. 2007; 447: 279-283
論文で見る
スコープス (1124)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デュネイ E.
アパクパクルK.
レアード S.
パーマー J.L.
ディーム S.L.
ヒトから大型類人猿への病原体感染は、霊長類の保護にとって増大する脅威である。
EcoHealth. 2018; 15: 148-162
論文で見る
スコープス (57)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
モシテス E.
サモンズM.
オティアンE.
エング A.
ノエッカー C.
マナー O.
ヒルトン S.
トゥンビ S.M.
オニャンゴ C.
ガーランド=ルイスG.
他。
ケニア西部における子供、家畜、家庭表面間のマイクロバイオーム共有。
PLoS One. 2017; 12e0171017
論文で見る
スコープス (40)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
スミス W.P.J.
ウーチャーB.R.
ナデルC.D.
フォスター K.R.
細菌の防御:メカニズム、進化、抗菌剤耐性。
Nat. Rev. Microbiol. 2023; 21: 519-534
論文で見る
スコープス (13)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ヤン・W.
ホール A.B.
Jiang X.
ヒト腸内のバクテロイデス属細菌は、可逆的プロモーターによって制御される抗生物質耐性遺伝子のリザーバーである。
npj Biofilms Microbiomes. 2022; 8: 1-9
論文で見る
スコパス (6)
クロスフィルム
グーグル奨学生
マキエル=ゲラ A.
ベイカーM.
Hu Y.
Wang W.
Zhang X.
Rong J.
チャン Y.
チャン J.
Kaler J.
レニー D.

ヒト、土壌、家畜が相互に関連する微生物群集とレジストームの解析。
ISME J. 2023; 17: 21-35
論文で見る
スコープス (8)
参考文献
グーグル奨学生
ポンバ C.
ランタラM.
グレコ C.
バプティスト K.E.
カトリーB.
ファン・ドゥイケレン E.
マテウス A.
モレノ M.A.
ピョラーラ S.
ルジャウスカス M.
他。
コンパニオンアニマルからの抗菌薬耐性移行の公衆衛生リスク。
J. Antimicrob. Chemother. 2017; 72: 957-968
論文で見る
PubMed
グーグル奨学生
Chang Q.
Wang W.
レゲブ・ヨーチェイG.
リプシッチ M.
ハナゲ W.P.
農業における抗生物質と人間の健康へのリスク: どの程度心配すべきか?
Evol. Appl. 2015; 8: 240-247
論文で見る
スコープス (353)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
クーニンE.V.
ドルヤV.V.
クルポヴィッチ M.
健康なヒトのウイルス群: ウイルス-宿主共生から疾患まで。
Curr. Opin. Virol. 2021; 47: 86-94
論文で見る
スコープス (0)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ゴレシ Z.-A.-S.
モラエイ H.R.
アレフィニア N.
ヒト癌におけるDNAウイルスの役割。
Cancer Inform. 2023; 2211769351231154186
論文で見る
グーグル奨学生
アーゼ C.A.
シュプリンガー S.
デュダスG.
パテル S.
バタチャリヤ A.
スワミナサン H.
ブルグナーラ C.
デラグレイブ S.
オン T.
カーヴェジャンA.
他。
グローバルゲノム解析により、ヒトビローム内の広大かつダイナミックなアネロウイルスランドスケープが明らかになった。
Cell Host Microbe. 2021; 29: 1305-1315
論文で見る
日本
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
シン S.
ブラッカード J.T.
サハラ以南のアフリカにおけるヒトペジウイルス(HPgV)感染-新たな研究課題の必要性。
Rev. Med. Virol. 2017; 27e1951
論文で見る
スコープス (12)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ラオック M.
ベイリー A.L.
アンデルセン K.G.
ゴールドバーグ T.L.
サベティ P.C.
オコナー D.H.
西アフリカのエボラ出血熱患者におけるGBウイルスCの重複感染。
J. Virol. 2015; 89: 2425-2429
論文で見る
PubMed
クロスレフ
グーグル奨学生
フリーア G.
マッジF.
Pifferi M.
ディ・チッコ M.E.
ペローニ D.G.
ピステロ M.
ビロームとその主要な構成要素であるアネロウイルスは、ヒトの免疫防御を形成する複雑なシステムであり、小児期の喘息や呼吸器疾患の発症に影響を及ぼす可能性がある。
フロント。Microbiol. 2018; 9: 686
論文で見る
スコープス (62)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
カーンバウアー E.
Ding Y.
カドウェル K.
腸内ウイルスは常在細菌の有益な機能に取って代わることができる。
Nature. 2014; 516: 94-98
論文で見る
スコープス (368)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ヴァージン H.W.
哺乳類の生理と疾患におけるウイルスーム。
Cell. 2014; 157: 142-150
論文で見る
スコープス (435)
PubMed
概要
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ゴガルテンJ.F.
リューレマンM.
アーチー E.
トゥン J.
アクアコフィC.
バン C.
デシュナー T.
ムヤンベ・タムフン J.
ロビンス M.M.
シューベルトG.
他。
霊長類のファージオームは、スーパーホストの系統樹と環境によって構造化される。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 2021; 118e2013535118
論文で見る
スコープス (9)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
クーニン E.V.
Yutin N.
crAss様ファージ群: メタゲノム解析によるヒトのウイルス群の再構築。
Trends Microbiol. 2020; 28: 349-359
論文で見る
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ユーティンN.
マカロワ K.S.
グッソウ A.B.
クルポヴィッチ M.
セガール A.
エドワーズ R.A.
クーニン E.V.
ヒトの腸内に最も多く存在するウイルスを含む、広大なバクテリオファージファミリーの発見。
Nat. Microbiol. 2018; 3: 38-46
論文で見る
スコープス (174)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ジョルジョンH.
ベルンハイム A.
細菌の高度に多様な抗ファージ防御システム。
Nat. Rev. Microbiol. 2023; 21: 686-700
論文で見る
スコパス (8)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ミルザエイ M.K.
モーリス C.F.
ヒト腸内におけるメナージュ・ア・トロワ: 宿主、細菌、ファージの相互作用。
Nat. Rev. Microbiol. 2017; 15: 397-408
論文で見る
スコープス (213)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
モレノ-ガジェゴJ.L.
チョウ S.-P.
ディ・リエンジ S.C.
グッドリッチJ.K.
スペクター T.D.
ベル J.T.
ヤングブラット N.D.
ヒューソン I.
レイエス A.
レイ R.E.
成人の一卵性双生児において、ウイルロームの多様性は腸内細菌叢の多様性と相関する。
Cell Host Microbe. 2019; 25: 261-272
論文で見る
スコープス (116)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ドレイパー L.A.
ライアン F.J.
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スコープス (0)
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グーグル奨学生
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新井康弘
広瀬直己
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百寿者には多様な腸内ビロームが存在し、代謝を調節して健康寿命を促進する可能性がある。
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スコープス (9)
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クロス
グーグル奨学生
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パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
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要旨
全文
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スコープス (0)
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社会的に伝播した腸内細菌叢は、腸内寄生虫からマルハナバチを守る。
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憂鬱な気分を移す: うつ病に関連した腸内細菌叢がラットの神経行動学的変化を誘発する。
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腸内細菌叢はパーキンソン病モデルにおける運動障害と神経炎症を制御する。
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全文PDF
グーグル奨学生
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グーグル奨学生
シヴァン A.
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ウィリアムズJ.B.
アキーノ=マイケルズK.
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ベニヤミン F.W.
レイ Y.M.
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ビフィズス菌は抗腫瘍免疫を促進し、抗PD-L1効果を促進する。
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論文で見る
スコープス (2515)
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クロス
グーグル奨学生
ヘンリックJ.
私たちの成功の秘密: 文化はいかに人類の進化を促し、種を家畜化し、我々を賢くしたか。
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記事で見る
クロスフィルム
グーグル・スカラー
記事情報
記事情報
DOI: https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.12.014

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