研究内容プレスプレビュー消化器病学オープンアクセス｜10.1172/jci.insight.170181
潰瘍性大腸炎、クローン病、セリアック病に関与するlncRNAを粘膜トランスクリプトミクスで明らかにする

https://insight.jci.org/articles/view/170181

Tzipi Braun, 1 Katya E. Sosnovski, 2 Amnon Amir, 3 Marina BenShoshan, 2 Kelli L. VanDussen, 4 Rebekah Karns, 4 Nina Levhar, 5 Haya Abbas-Egbariya, 6 Rotem Hadar, 2 Gilat Efroni, 2 David Castel, 2 Camila Avivi, 7 Michael J. Rosen, 8 Anne M. Grifiths, 9 Thomas D. Walters, 10 David R. Mack, 11 Brendan M. Boyle、12 Syed Asad Ali、13 Sean R. Moore、14 Melanie Schirmer、15 Ramnik J. Xavier、16 Subra Kugathasan、17 Anil G. Jegga、18 Batya Weiss、6 Chen Mayer、6 Iris Barshack、6 Shomron Ben-Horin 、5 Igor Ulitsky、20 Anthony Beucher、21 Jorge Ferrer、22 Jeffrey S. Hyams、23 Lee A. Denson、24 および Yael Haberman25
2023年6月1日発行 - 詳細はこちら
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要旨
潰瘍性大腸炎（UC）、クローン病（CD）、セリアック病は、治療介入に満足できない腸の炎症性疾患の代表的な疾患である。患者データを基にしたコホートを分析することで、疾患パスウェイや新たな治療標的を明らかにすることができる。ロングノンコーディングRNA（lncRNA）は、RNA治療薬の標的となりやすく、細胞特異的な発現を示し、重要な細胞機能を担っていることから、魅力的な候補である。我々は、696名の被験者の腸粘膜トランスクリプトミクスを統一的に解析し、消化管に沿ったlncRNAの発現を明らかにし、コントロールサンプルでは、lncRNAはタンパク質コード遺伝子と比較して、より位置特異的な発現を持っていることを実証しました。治療歴のないUC、CD、セリアック病におけるlncRNAの制御異常を、独立した試験および検証コホートを用いて定義しました。PROTECT inception UCコホートを用いて、UCの重症度と将来のアウトカムに関連するlncRNAを定義し優先順位を付け、粘膜の恒常性に以前から関与している腸内微生物に関連するlncRNAを明らかにした。HNF1A-AS1 lncRNAは、3つの条件すべてで減少し、より重症のUC型ではさらに減少していた。同様に、マウスの腸上皮におけるHNF1A-AS1オルソログの減少は、デキストラン硫酸ナトリウム誘発性大腸炎に対する感受性を高め、腸内細菌群集の変化と連動していることが示された。これらの解析により、優先的に制御されるlncRNAが明らかになり、新規ターゲットとして前臨床試験を行うための指針になると考えられる。
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バージョン履歴
バージョン1（2023年6月1日）： インプレスプレビュー
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ISSN 2379-3708
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