ヒトにおけるサルモネラ菌の持続的感染は、BarA/SirA制御経路の変異と関連している

メインコンテンツへスキップ
広告

インスピレーションを与える科学Cell Pressジャーナル
細胞宿主微生物
ログイン

検索...

論文|第32巻第1号、p79-92.e7、2024年1月10日号

全号ダウンロード
ヒトにおけるサルモネラ菌の持続的感染は、BarA/SirA制御経路の変異と関連している

https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(23)00490-0

アレクサンドラ・グローテ
バー・ピスコン
アビゲイル・L・マンソン
ジョナサン・リブニー
アシュリー・M・アール
オハッド・ガルモール4
すべての著者を表示

脚注を表示するDOI:https://doi.org/10.1016/j.chom.2023.12.001

ハイライト

サルモネラのグローバルレギュレーターはヒトに持続感染する間に頻繁に変異する

BarA/SirA病原性制御経路が最も頻繁に変異していた。

barA/sirA変異体は病原性が低く、宿主の免疫反応を弱めた。

barA/sirA変異体はマウスに定着し、持続性サルモネラ症の間に排出された。
まとめ
サルモネラ菌を含むいくつかの細菌性病原体は、ほとんど解明されていないメカニズムによってヒトに持続感染を引き起こすことがある。我々は、256人の遷延性サルモネラ症患者から縦断的に収集した分離株のゲノムを比較することにより、複数の患者およびサルモネラ血清群にわたって、barA/sirA2成分制御系を含むグローバル制御因子における反復変異を同定した。比較RNA-seq解析の結果、barA/sirAの異なる変異により、サルモネラの侵入と腸炎に必要なサルモネラ病原性アイランド1および4遺伝子の発現が低下することが明らかになった。さらに、barA/sirA変異体は、急性サルモネラ症モデルマウスで減弱し、宿主免疫応答の弱い転写を誘導した。一方、持続感染マウスモデルでは、これらの変異体は長期間のコロニー形成と長期間の排出を示した。これらの知見を総合すると、グローバルな病原性制御因子の変異の選択は、サルモネラの病原性を減弱させ、宿主の炎症反応を弱く誘導することにより、ヒトにおけるサルモネラの持続感染を促進することが示唆される。
図解抄録
図サムネイルfx1
大きな画像を見る 高解像度画像をダウンロードする
キーワード
サルモネラ
サルモネラ症
持続性
慢性感染症
ゲノミクス
トランスクリプトミクス
BarA/SirA
二成分制御システム
病原性制御
宿主免疫応答
この論文の全文を読むには、支払いが必要です。
1回限りのアクセスを購入する:
アカデミック&パーソナル:24時間オンラインアクセス
企業の研究開発担当者: 24時間オンラインアクセス
今すぐ読む
HTML記事全文へのアクセスを6時間または36時間、低料金でご購入いただけます。こちらをクリックしてください。

1回限りのアクセス料金
購読する
細胞宿主と微生物
既に印刷版を購読されていますか?オンラインアクセスを申請する
既にオンライン購読者ですか?サインイン
登録する アカウントを作成する
機関アクセス ScienceDirectにサインイン
参考文献
コーエン N.R.
ロブリッツ M.A.
コリンズ J.J.
微生物の持続性と薬剤耐性への道。
Cell Host Microbe. 2013; 13: 632-642
記事で見る
スコープス(352)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
イッセンフート-ジャンジャンS.
ロジェンティンP.
ミコリット M.
ギブルデンシュ M.
ド・ピンナ E.
ナイル S.
フィールズ P.I.
ワイル F.X.
White-Kauffmann-Le Minorスキームの補足2008-2010(第48号)。
Res. Microbiol. 2014; 165: 526-530
論文で見る
スコープス (266)
パブコメ
クロス
グーグル奨学生
Gal-Mor O.
腸チフス性および非腸チフス性サルモネラ菌の持続感染と長期保菌。
Clin. Microbiol. Rev. 2019; 32e00088-18
論文で見る
PubMed
グーグル奨学生
クランプ J.A.
ルビーS.P.
ミンツE.D.
腸チフスの世界的負担。
Bull. World Health Organ. 2004; 82: 346-353
記事で見る
パブコメ
グーグル奨学生
ハベラーA.H.
カーク M.D.
トガーソンP.R.
ギブ H.J.
ハルド T.
レイク R.J.
プラート N.
ベリンジャー D.C.
デ・シルバ N.R.
ガルグリN.
他。
2010年における食中毒の負担に関する世界保健機関(WHO)の世界推定値と地域比較。
PLOS Med. 2015; 12e1001923
論文で見る
スコープス(1079)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ガラン J.E.
サルモネラと宿主細胞との相互作用:III型分泌の働き。
Annu. Rev. Cell Dev. 2001; 17: 53-86
論文で見る
スコパス (609)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ミルズ D.M.
バジャジV.
リー C.A.
サルモネラ・チフスムリウムの侵入遺伝子をコードする40kbの染色体断片は、大腸菌K-12染色体の対応する領域には存在しない。
Mol. Microbiol. 1995; 15: 749-759
論文で見る
スコープス (295)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
パブロワB.
ヴォルフJ.
オンドラコバP.
マティアソヴィッチJ.
ステパノヴァ H.
クラノバ M.
カラソワ D.
ファルディナ M.
Rychlik I.
サルモネラ菌のSPI-1コード化III型分泌系はブタ肺胞マクロファージサイトカイン発現抑制に必要である。
Vet. Res. 2011; 42: 16
論文で見る
日本獣医学会雑誌
PubMed
クロス
グーグル奨学生
趙X.
唐 X.
Guo N.
An Y.
Chen X.
Shi C.
Wang C.
Li Y.
Li S.
Xu H.
et al.
ビオチャニンAは、AMPK/ULK1/mTORを介したオートファジーと細胞外トラップ、およびSPI-1依存的なマクロファージ(MΦ)のM2極性化を逆転させることにより、サルモネラ菌感染に対する防御を増強する。
Front. Cell. Infect. Microbiol. 2018; 8: 318
論文で見る
スコープス (36)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
セキーロフ I.
ギル N.
ジョゴバ M.
タム N.
ロバートソン M.
デ・ラノス R.
リー Y.
フィンレイ B.B.
腸管大腸炎におけるサルモネラSPI-1を介した好中球の動員は、腸内細菌叢の減少と変化に関連している。
Gut Microbes. 2010; 1: 30-41
論文で見る
日本
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ウィンター S.E.
ティエンニミットルP.
ウィンター M.G.
バトラーB.P.
ヒューズビーD.L.
クロフォード R.W.
ラッセル J.M.
ベビンズ C.L.
アダムス L.G.
ツォリスR.M.

腸の炎症はサルモネラに呼吸電子受容体を提供する。
Nature. 2010; 467: 426-429
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オッシュマン H.
ソンチーニF.C.
ソロモンF.
グロイスマン E.A.
宿主細胞内でのサルモネラの生存に必要な病原性アイランドの同定。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996; 93: 7800-7804
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シアJ.E.
ヘンゼルM.
グリーソンC.
ホールデン D.W.
Salmonella typhimuriumにおける第二のIII型分泌系をコードする病原性遺伝子座の同定。
Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1996; 93: 2593-2597
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ルー L.
チャン P.
Piao R.
Wang Y.
サルモネラ病原性アイランド1(SPI-1)とその複雑な制御ネットワーク。
Front. Cell. Infect. Microbiol. 2019; 9: 270
論文で見る
スコープス (159)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マルティネス L.C.
ヤクニンH.
カマーチョM.I.
ゲオルゲリスD.
バビツケ P.
プエンテ J.L.
ブスタマンテ V.H.
HilDを介してサルモネラ菌SPI-1およびSPI-2ビルレンスレギュロンの発現を制御するSirA/BarAおよびCsrグローバル制御系を含む複雑な制御カスケードの統合。
Mol. Microbiol. 2011; 80: 1637-1656
論文で見る
スコパス (121)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ベーラウ I.
ミラー S.I.
PhoPで抑制された遺伝子がSalmonella typhimuriumの上皮細胞への浸潤を促進する。
J. Bacteriol. 1993; 175: 4475-4484
論文で見る
スコープス (234)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
エラーマイヤーJ.R.
スラウチ J.M.
宿主環境への適応:Salmonella enterica serovar TyphimuriumにおけるSPI1タイプIII分泌系の制御。
Curr. Opin. Microbiol. 2007; 10: 24-29
論文で見る
スコープス(230)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
テプリツキー M.
グディエR.I.
アーメルB.M.M.
サルモネラのBarA/SirAから運動性と病原性遺伝子発現に至る経路。
J. Bacteriol. 2003; 185: 7257-7265
論文で見る
スクパス (123)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ヒーブ S.
Haas D.
植物関連細菌およびその他のグラム陰性細菌におけるGacS/GacA二成分系の制御的役割。
Mol. Plant. Microbe Interact. 2001; 14: 1351-1363
論文で見る
スコープス (359)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
フォスターN.
タン Y.
ベルキエリ A.
Geng S.
ジャオ X.
バローP.
サルモネラの持続感染と保菌状態の再検討:我々は何を知っているか?
病原体。2021; 10: 1299
論文で見る
スコパス (12)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
J Barton A.
ヒル J.
J Blohmke C.
JポラードA.
腸チフス型サルモネラの宿主制限、病原性および慢性保菌。
FEMS Microbiol. Rev. 2021; 45: fuab014
論文で見る
スコパス (7)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
マルツェル A.
デサイ P.T.
ゴーレンA.
ショアー Y.I.
ニッサン I.
ポルヴォリック S.
ヴァリンスキー L.
マクレランド M.
ラハブ G.
ガル・モールO.
ヒトにおける非チフス性サルモネラ菌の持続感染:疫学と遺伝学。
Clin. Infect. Dis. 2016; 62: 879-886
論文で見る
スコープス (73)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ブッフバルトD.S.
ブレイザー M.J.
ヒトサルモネラ症に関する総説:II. 非定型サルモネラ菌感染後の排泄期間。
Rev. Infect. Infect. 1984; 6: 345-356
論文で見る
スコパス (216)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ディクソン J.M.
小児におけるSalmonella typhimuriumの排泄期間に対する抗生物質治療の影響。
Br. Med. J. 1965; 2: 1343-1345
論文で見る
スコパス (79)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マッシャーD.M.
ルーベンスタインA.D.
非定型サルモネラ菌の永久保菌者。
Arch. Intern. Med. 1973; 132: 869-872
論文で見る
スコープス (55)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Vogelsang Th.M.
Bøe J.
Salmonella typhiおよびSalmonella paratyphiの一時的および慢性保菌者B.J. Hyg.
J. Hyg. 1948; 46: 252-261
論文で見る
スコパス (35)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ステッチャー B.
ハードW.D.
腸の病原体コロニー形成を制御するメカニズム。
Curr. Opin. Microbiol. 2011; 14: 82-91
論文で見る
スコープス (298)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
オクタヴィア S.
王 Q.
タナカ M.M.
シンチェンコ V.
ラン・R.
長期保菌に関連したSalmonella Enterica serovar Typhimuriumのヒト連続分離株のゲノム変異性。
J. Clin. Microbiol. 2015; 53: 3507-3514
論文で見る
スコープス (21)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キム D.
ソン L.
ブライトヴィーザーF.P.
Salzberg S.L.
遠心分離:メタゲノム配列の迅速かつ高感度な分類。
ゲノム研究 2016; 26: 1721-1729
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
マーセリス J.G.
ケイ D.
コノリーC.S.
フックE.W.
腸チフスキャリア状態の定量的細菌学。
Am. J. Trop. Med. Hyg. 1964; 13: 425-429
論文で見る
スコパス (36)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
村瀬敏彦
山田雅史
武藤敏郎
松島明
山井聡
食中毒発生後のSalmonella enterica Serovar typhimuriumの糞便中排泄量.
J. Clin. Microbiol. 2000; 38: 3495-3497
論文で見る
パブコメ
クロスレフ
グーグル奨学生
ロバートソン J.
ナッシュ J.H.E.
MOB-suite:ドラフトアセンブリーからのプラスミドのクラスタリング、再構築、タイピングのためのソフトウェアツール。
Microb. Genom. 2018; 4
論文で見る
グーグル・スカラー
アルコック B.P.
ラフェニア A.R.
ラウ T.T.Y.
ツァン K.K.
ブシャール M.
エダラトマンド A.
フイン W.
グエン A.-L.V.
チェン A.A.
リュー S.
他。
CARD 2020:包括的抗生物質耐性データベースを用いた抗生物質レジストーム監視。
Nucleic Acids Res. 2020; 48: D517-D525
論文で見る
PubMed
グーグル奨学生
オンドフ B.D.
トレアンゲンT.J.
メルステッドP.
マロニーA.B.
バーグマン N.H.
コレン S.
Phillippy A.M.
Mash:MinHashを用いたゲノムおよびメタゲノム距離の高速推定。
ゲノム生物学 2016; 17: 132
論文で見る
スコープス (1416)
PubMed
Crossref
グーグル奨学生
プラット D.J.
タガートJ.
Heraghty K.A.
サルモネラ・チフスムリウムのヒト由来株と動物由来株における血清型特異的プラスミド(pSLT)の分子分岐と、pSLTとS. EnteritidisおよびS. Dublinの血清型特異的プラスミドとの比較。
J. Med. Microbiol. 1988; 27: 277-284
論文で見る
スコープス (31)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
コーエン E.
ラハブG.
Gal-Mor O.
新興サルモネラ菌Salmonella Enterica serovar Infantisのゲノム配列と他のS. Infantis株とのゲノム比較。
Genome Biol. 2020; 12: 151-159
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ナディン・デイビス S.
ポープL.
Chmara J.
デュセップ M.O.
バーク T.
デベニッシュ J.
アンドリエフスカイアO.
アラン・R.
オグンレミ D.
prot6e遺伝子を欠く改変型病原性プラスミドを持つ珍しいSalmonella enteritidis株は、地理的に広く分布する系統を代表する。
Front. Microbiol. 2020; 11: 1322
論文で見る
スコープス (1)
クロス
グーグル奨学生
ダニチェク P.
オートンA.
アベカシスG.
アルバースC.A.
バンクス E.
デプリスト M.A.
ハンザカー R.E.
ルンター G.
マース G.T.
シェリーS.T.
et al.
バリアントコールフォーマットとVCFtools。
Bioinformatics. 2011; 27: 2156-2158
論文で見る
論文リスト
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ウルティア I.M.
フエンテスJ.A.
バレンズエラL.M.
オルテガ A.P.
イダルゴ A.A.
モラ G.C.
Salmonella Typhi shdA:偽遺伝子か対立遺伝子変異体か?
Infect. Genet. Evol. 2014; 26: 146-152
論文で見る
スコープス (16)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ハメッド S.
ワン X.
シャウキー R.M.
エマラ M.
オルドリッジ P.D.
ラオ C.V.
Salmonella enterica serovar typhimuriumにおけるSPI-1遺伝子発現と鞭毛システムとの転写クロストークによる相乗作用。
BMC Microbiol. 2019; 19: 211
論文で見る
スコープス (10)
クロストーク
グーグル奨学生
イバラ J.A.
クノドラーL.A.
スターデヴァント D.E.
ヴィルタネヴァ K.
カーモディ A.B.
フィッシャー E.R.
ポーセラ S.F.
スティール=モーティマー O.
異なる増殖条件下におけるサルモネラ病原性アイランド1の誘導は、in vitroにおけるサルモネラ-宿主細胞相互作用に影響を与え得る。
微生物学(読書)。2010; 156: 1120-1133
論文で見る
スコパス(117)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キム K.
ゴルベバ Y.A.
ヴァンダプールC.K.
Slauch J.M.
Salmonella Enterica serovar Typhimuriumにおける低分子RNAによるSPI1 3型分泌系の酸素依存的制御。
Mol. Microbiol. 2019; 111: 570-587
論文で見る
スコープス (16)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マルティネス-フローレスI.
ペレス-モラレスD.
サンチェス-ペレスM.
パレデス C.C.
コラド=ビデス J.
サルガド H.
ブスタマンテ V.H.
サルモネラ菌グローバル遺伝子発現データのインシリコクラスタリングにより、HilDを介してSPI-1病原性遺伝子と共制御される新規遺伝子が明らかになった。
Sci. Rep. 2016; 6: 37858
論文で見る
スコープス (18)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シンガーH.M.
エルハルトM.
ヒューズ K.T.
サルモネラ菌べん毛マスターオペロンflhDCの自己制御における転写抑制因子としてのRflMの機能。
J. Bacteriol. 2013; 195: 4274-4282
論文で見る
スコパス (23)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
シンガー H.M.
キューネC.
デディティウスJ.A.
ヒューズ K.T.
エルハルト M.
サルモネラ菌Spi1病原性制御タンパク質HilDは、べん毛マスターオペロンflhDCの転写を直接活性化する。
J. Bacteriol. 2014; 196: 1448-1457
論文で見る
スコパス (69)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シェルトンC.D.
Yoo W.
シーリー N.G.
トーレス T.P.
ジーバ J.K.
カルカット M.W.
フォージング N.J.
キム・D.
キム J.
リュウ S.

Salmonella Enterica serovar Typhimuriumは、嫌気性呼吸を利用してプロピオン酸を介したコロニー形成抵抗性を克服する。
Cell Rep.
論文で見る
スコパス (18)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル・スカラー
パーマー A.D.
スラウチ J.M.
動物モデルにおけるサルモネラ菌の病原メカニズム。
Hum. Ecol. Risk Assess. 2017; 23: 1877-1892
論文で見る
スコープス (23)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ホフマン S.
シュミットC.
ウォルター S.
ベンダーJ.K.
ゲルラッハ R.G.
最適化された方法による最大7つのメチル受容性走化性遺伝子の欠損により、サルモネラ・チフス菌におけるChemMの重要な機能が明らかになった。
PLoS ONE. 2017; 12e0172630
論文で見る
スコパス (31)
クロスフィルム
グーグル奨学生
カトリベ E.
ボゴモルナヤL.M.
ウィンガートH.
Andrews-Polymenis H.
サルモネラ菌IIIa亜種およびIIIb亜種は、サルモネラ・エンテリカ・subsp.
J. Bacteriol. 2009; 191: 2843-2850
論文で見る
スコパス (16)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
プラント J.E.
ヒッグス G.A.
イースモンC.S.
マウスモデルにおけるサルモネラ・チフスムリウム慢性感染に対する抗炎症剤の効果。
Infect. Immun. 1983; 42: 71-75
論文で見る
スコパス (6)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ウィーニング E.H.
バーカーJ.D.
ララッカーM.C.
ハンフリーズ A.D.
ツォリスR.M.
バウムラー A.J.
Salmonella enterica serotype Typhimurium lpf, bcf, stb, stc, std, sthの各フィンブリアオペロンはマウスにおける腸内持続性に必要である。
Infect. Immun. 2005; 73: 3358-3366
論文で見る
(147件)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バーテルJ.A.
ソマーL.M.
ハーゲンセンJ.A.J.
ロッホ A.
エスピノーサ R.
モーリン S.
ヨハンセン H.K.
持続的細菌感染に対する進化の王道。
Nat. Commun. 2019; 10: 629
論文で見る
スコープス (72)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マーヴィグR.L.
ソマーL.M.
Molin S.
ヨハンセン H.K.
嚢胞性線維症患者における緑膿菌の収斂進化と適応。
Nat. Genet. 2015; 47: 57-64
論文で見る
(株)スクープス (374)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ロング D.R.
ウォルター D.J.
リーM.
プレシット M.
マクリーンK.
ホームズ E.
ペネウィット K.
ワアルケス A.
ホフマン L.R.
サリパンテ S.J.
慢性嚢胞性線維症黄色ブドウ球菌気道感染症におけるポリクローナリティ、共有株、収斂進化。
Am. J. Respir. Crit. Care Med. 2021; 203: 1127-1137
論文で見る
スコープス (26)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
カデミ S.M.H.
ガブリエライトM.
ポールソンM.
クヌルスト M.
トゥーリキ E.
マーヴィグ R.L.
ポールマンL.I.
嚢胞性線維症患者の慢性気道感染におけるAchromobacter xylosoxidansのゲノムおよび表現型の進化。
mSystems. 2021; 6e0052321
論文で見る
スコープス (9)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ラヴィーン J.P.
ホスニー M.
デュニャック-レミーC.
ブテ・デュボア A.
シュルディナー S.
セリエ N.
ヤヒアウイ=マルティネス A.
モレ V.
ラ・スコラ B.
マルシャンディンH.
他。
糖尿病患者の足感染症における黄色ブドウ球菌の長期的な宿主内進化。
Front. Microbiol. 2021; 12: 741406
論文で見る
スコープス (6)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ブライアント J.M.
ブラウン K.P.
バーボー S.
エバーオール I.
ベラルディネリ J.M.
ロドリゲス-リンコンD.
グロゴノ D.M.
ピーターソン C.M.
ヴェルマ D.
エバンスI.E.
et al.
膿瘍菌の段階的病原性進化。
Science. 2021; 372: EAB8699
論文で見る
スコパス (74)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キドワイ A.S.
ムシャミリ I.
ニーマンG.S.
ブラウン R.N.
アドキンス J.N.
ヘフロン F.
マウス感染モデルにおけるサルモネラの持続性には、多様な分泌型エフェクターが必要である。
PLoS ONE. 2013; 8e70753
論文で見る
スコパス (26)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ローリー T.D.
ブーリーD.M.
ホイ Y.E.
ゲルケ C.
レルマンD.A.
モナックD.M.
Salmonella Enterica serovar Typhimuriumの宿主伝播は病原因子と常在腸内細菌叢によって制御されている。
Infect. Immun. 2008; 76: 403-416
論文で見る
日本
PubMed
クロス
グーグル奨学生
キス T.
モーガンE.
Nagy G.
腸管サルモネラの病原性に対するSPI-4遺伝子の寄与。
FEMS Microbiol. Lett. 2007; 275: 153-159
論文で見る
日本
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ハサン M.K.
スコット N.E.
ヘイズ M.P.
ハードウィッジ P.R.
エル・カイディ S.
サルモネラ菌のT3SSエフェクターSseK1は、2成分応答制御因子OmpRをアルギニン-グリコシル化し、胆汁酸耐性を変化させる。
Sci. Rep. 2023; 13: 9018
論文で見る
スコープス (1)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ミャオ E.A.
マオ D.P.
ユドコフスキー N.
ボノー R.
ロラン C.G.
ウォレン S.E.
リーフ I.A.
アデレムA.
NLRC4インフラマソームによるIII型分泌装置の自然免疫検出。
Proc. Natl. Sci. USA. 2010; 107: 3076-3080
論文で見る
スコープス (617)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
サルベールH.
グロイスマン E.A.
サルモネラ菌の非コグネート制御因子RcsBを活性化するリン酸化酵素BarA/SirA。
PLOS Genet. 2020; 16e1008722
論文で見る
スコパス (13)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
Zhu Y.Y.
マクレダー E.M.
チェンチク A.
Li R.
シーバート P.D.
逆転写酵素テンプレートスイッチング:完全長cDNAライブラリー構築のためのSMART™アプローチ。
BioTechniques. 2001; 30: 892-897
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ワン R.F.
クシュナー S.R.
大腸菌におけるクローニング、配列決定および遺伝子発現のための汎用性の高い低コピー数ベクターの構築。
Gene. 1991; 100: 195-199
論文で見る
遺伝子発現
PubMed
クロス
グーグル奨学生
Li H.
BWA-MEMによるシーケンスリード、クローン配列、アセンブリーコンティグのアライメント。
arXiv. 2013;
論文で見る
Google Scholar
ウォーカー B.J.
アビールT.
シア T.
プリーストM.
アブーエルA.
サクティクマール S.
クオモ C.A.
ゼン Q.
ウォートマン J.
ヤング S.K.
他。
Pilon:包括的な微生物バリアント検出とゲノムアセンブリ改良のための統合ツール。
PLOS One. 2014; 9e112963
論文で見る
スコープス (4807)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
プライス M.N.
デハル P.S.
Arkin A.P.
FastTree 2 - ラージアラインメントのための近似最尤ツリー。
PLOS One. 2010; 5e9490
論文で見る
スコープス (8207)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
レトゥニック I.
ボーク P.
生命樹のインタラクティブツリー(iTOL)v5:系統樹表示とアノテーションのためのオンラインツール。
2021年; 49: W293-W296
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
Crossref
グーグル奨学生
ディドロX.
ウィルソン D.J.
ClonalFrameML:全細菌ゲノムにおける組換えの効率的推論。
PLOS Comput. Biol. 2015; 11e1004041
論文で見る
スコープス (511)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バンケビッチ A.
ヌルクS.
アンティポフD.
グレビッチA.A.
ドボルキン M.
クリコフ A.S.
レシン V.M.
ニコレンコ S.I.
ファム S.
Prjibelski A.D.

SPAdes: 新しいゲノムアセンブリーアルゴリズムとシングルセルシーケンスへの応用。
J. Comput. 2012; 19: 455-477
論文で見る
ゲノムアセンブリ
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ロバートソン J.
ベッソノフK.
ションフェルドJ.
ナッシュ J.H.E.
普遍的な全塩基配列ベースのプラスミド型別と宿主範囲の予測および疫学的サーベイランスへのその有用性。
Microb. Genom. 2020; 6
論文で見る
PubMed
グーグル奨学生
ファン・ダイク L.R.
ウォーカーB.J.
ストローブT.J.
ウォービーC.J.
グローテ A.
シュライバーH.L.
アニャンシ C.
ピッカリング A.J.
ハルトグレン S.J.
マンソンA.L.

StrainGE:複雑な微生物群集における低存在株の追跡と特性解析のためのツールキット。
Genome Biol.
論文で見る
日本学術振興会特別研究員
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マデイラ F.
パク Y.M.
リーJ.
ブソ N.
ガー T.
マドゥスーダナン N.
バスツカー P.
ティヴェイ A.R.
ポッター S.C.
フィン R.D.
Lopez R.
2019年のEMBL-EBI検索および配列解析ツールAPI。
Nucleic Acids Res. 2019; 47: W636-W641
論文で見る
スコープス (2935)
PubMed
Crossref
グーグル奨学生
クマール S.
ステッチャーG.
Li M.
Knyaz C.
田村 圭一
MEGA X: コンピューティングプラットフォームを横断した分子進化遺伝学解析。
Mol. Biol. Evol. 2018; 35: 1547-1549
論文で見る
スコープス(22901)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ロビンソン M.D.
マッカーシー D.J.
Smyth G.K.
edgeR:デジタル遺伝子発現データの差分発現解析のためのBioconductorパッケージ。
Bioinformatics. 2010; 26: 139-140
論文で見る
(株)昭文社(24318)
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
リー・エイチ
ダービン R.
Burrows-Wheeler変換を用いた高速で正確なショートリードのアライメント。
Bioinformatics. 2009; 25: 1754-1760
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
アズリエル S.
ゴーレンA.
ラハブG.
Gal-Mor O.
ストリンジェント応答制御因子DksAは、最小培地でのサルモネラ腸炎菌(Salmonella enterica serovar Typhimurium)の増殖、運動性、バイオフィルム形成、腸内定着に必要である。
Infect. Immun. 2016; 84: 375-384
論文で見る
スコパス (44)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ボイチスE.
ラン・サピールS.
Herskovits A.A.
リステリア菌による骨髄由来マクロファージ(BMDM)感染。
Methods Mol. Biol.
論文で見る
スコープス (0)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
バタチャリヤ R.P.
バンディオパディヤイ N.
マー P.
ソン S.S.
Liu J.
He L.L.
ウー L.
Khafizov R.
ボイキン R.
セルケイラG.C.
他。
遺伝子型と表現型の同時検出により、迅速かつ正確な抗生物質感受性判定が可能になる。
Nat. Med. 2019; 25: 1858-1864
論文で見る
スコープス (65)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
シシキンA.A.
ジャンヌコスG.
クククラールA.
チウラ D.
バスビー M.
スルカ C.
チェン J.
バタチャリヤ R.P.
ルディ R.F.
パテル M.M.
et al.
1回の反応で多数のRNA-seqライブラリーを同時作製。
Nat. Methods. 2015; 12: 323-325
論文で見る
スコープス (183)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
コーエン H.
アダニB.
コーエンE.
ピスコンB.
アズリエルS.
デサイ P.
ベーレ H.
マクレランド M.
ラハブ G.
ガル・モールO.
先祖代々のストリンジェント応答増強因子DksAは、サルモネラの進化の過程で、代謝、運動性、病原性経路の発現を制御するために適応されてきた。
Gut Microbes. 2022; 14: 1997294
論文で見る
スコパス (3)
クロスリファレンス
グーグル・スカラー
論文情報
出版履歴
出版 2023年12月29日
受理 受理:2023年12月6日
改訂版受理 2023年10月4日
受理:2023年10月4日 2022年7月26日
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.chom.2023.12.001

著作権
© 2023 Elsevier Inc.
サイエンスダイレクト
ScienceDirectでこの論文にアクセスする
また、このような研究は、科学的根拠を欠くものである。このような、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で、曖昧で。このような試合では、このような試合はありません。このような稚魚は、その稚拙さゆえに、その稚拙さを際立たせることができず、また、その稚拙さゆえに、その稚拙さを際立たせることができない。このような素晴らしい試合は初めてです。私は、このような素晴らしいゲームをプレイすることはできません。 このような素晴らしい試合は初めてです。このような稚魚は、そのような稚拙な稚魚である可能性があります。

関連記事
広告

研究ジャーナル
細胞
癌細胞
細胞化学生物学
細胞ゲノム
細胞宿主と微生物
細胞代謝
細胞レポート
セルレポーツ医学
セルレポートメソッド
セルレポート 物理科学
細胞幹細胞
細胞システム
化学
化学触媒
カレントバイオロジー
発生細胞
ヘリオン
免疫
アイサイエンス
ジュール
物質
医学
分子細胞
ニューロン
一つの地球
パターン
STARプロトコル
構造
トレンドレビュージャーナル
生化学
バイオテクノロジー

細胞生物学
化学
認知科学
生態学・進化学
内分泌学・代謝学
遺伝学
免疫学
微生物学
分子医学
神経科学
寄生虫学
薬理学
植物科学
パートナージャーナル
AJHG
生物物理ジャーナル
生物物理学レポート
EBioMedicine
HGGアドバンス
分子植物
分子療法ファミリー
植物通信
幹細胞レポート
イノベーション
著者
論文投稿
複数ジャーナルへの投稿
STARメソッド
プレビュー - プレプリント

査読者
査読者向け情報

ニュース&イベント
ニュースルーム
細胞シンポジウム
コンソーシアムハブ
ウェビナー
ラボリンク

マルチメディア
セルプレスポッドキャスト
セルプレスビデオ
カラーリングとコミック
フィギュア360
セル画ショー
研究篇
セルプレスについて
セルプレスについて
オープンアクセス
COVIDハブ
持続可能性
インクルージョンと多様性

コンタクト
お問い合わせ
ヘルプ&サポート

採用情報
セルプレス採用情報
サイエンティフィックジョブボード
アクセス
登録する
請求
今すぐ読む
司書に推薦する
出版アラート
コレクション
ベスト・オブ・セルプレス
セルプレスレビュー
セルプレスセレクション
Nucleusコレクション
スナップショット・アーカイブ
インフォメーション
広告主の皆様へ
リクルーターの方へ
図書館員の方へ
プライバシーポリシー
ご利用条件
アクセシビリティ
本サイトのコンテンツは、あらゆる分野の医療従事者および研究者を対象としています。

当サイトでは、サービスの提供・向上やコンテンツのカスタマイズのためにクッキーを使用しています。クッキーの設定を更新するには、このサイトのクッキー設定をご覧ください。
このサイトのすべてのコンテンツ Copyright © 2024 Elsevier Inc.、そのライセンサー、および寄稿者。
テキストマイニング、データマイニング、AIトレーニング、および同様の技術に関するものも含め、すべての権利はエルゼビア社に帰属します。
すべてのオープンアクセスコンテンツには、クリエイティブ・コモンズのライセンス条件が適用されます。

プライバシーポリシー 利用規約 アクセシビリティ ヘルプ&サポート お問い合わせ
RELX

この記事が気に入ったらサポートをしてみませんか?