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大学院生が知るべきPubMed検索の詳細


PubMedを検索するのは簡単

PubMedは、米国国立医学図書館(NLM)が提供する、医学・生物学分野の論文データベースです。1966年から現在までの、約3,500万件以上の論文が収録されています。
PubMedは、研究者や医療従事者が、最新の医学・生物学研究の成果を調べるために使用されています。また、学生や一般の方も、医学・生物学に関する情報を調べるために使用することができます。
検索したい用語や概念を決めたら、検索ボックスに用語または概念を入力し、Enter キーを押すか Search をクリックします。
多くの検索では、特別なタグや構文を使用する必要はありません。PubMedでは、関連する検索結果を見つけやすくするために複数のツールを使用できます。

ソート順でBest Match を選択すると機械学習アルゴリズ ムにより最も関連性の高い引用文献を検索結果の上位に表示します。
オートコンプリート機能は、検索語を入力すると候補を表示します。この機能は、PubMedのクエリログ分析に基づいています。
スペルチェック機能は、スペルミスを含む可能性のある検索語の代替スペルを提案します。
引用センサーは、著者名、ジャーナルタイトル、出版日、論文タイトルなど、引用検索に特徴的な用語を含む検索結果候補を表示します。

検索結果の絞り込み

検索結果を絞り込みたい

検索結果が多すぎて、検索結果を絞り込みたい場合には、検索フィールド内に入力する一般的な検索用語を具体的な検索用語に置き換えると良いです。例えば、back pain を low back pain に置き換えてみましょう。また、サイドバーのフィルターを使用して、出版日、フルテキストの有無、論文のタイプなどで検索結果を絞り込むのも有効です。

検索範囲を拡げたい

逆に検索結果が少なすぎるときは、検索ボックスから不要な用語や特定の用語を削除することで、検索範囲を拡げることが出来ます。また、検索する概念を表す別の用語の使用を試みるのも良いでしょう。

フクロウは、夜行性で暗闇の中でも物を見ることができます。
膨大な論文データベースであるPubMedを利用することで必要な情報を見つけることができます。

一般的には、PubMedの検索結果は膨大な量になることが多いです。そのため、必要な情報を効率的に見つけるためには、検索結果を絞り込む必要があります。
PubMedでは検索フィールドタグを使用したり、サイドバーのフィルターを使用することで検索結果を絞り込むことができます。

特定の文献を検索したい

ある特定の論文を検索したいときには、論文のタイトルを検索ボックスに貼り付けるか、著者名、ジャーナル名、論文の出版年などの引用の詳細を検索ボックスに入力すると、PubMed引用センサーが引用情報のクエリを自動的に解析し正しい論文を表示します。引用センサーにはファジーマッチング・アルゴリズムが組み込まれており、検索に誤った用語が含まれていた場合でも最適な一致を検索します。

著者による検索を行いたい

著者による検索を行いたいときは、検索ボックスに著者の姓とイニシャル(句読点なし)を入力し、「検索」をクリックします。著者の姓しかわからない場合は、例えば brody[au] のように、著者名検索フィールドタグ[au]を使用します。smith ja のように、姓+イニシャルの形式、john a smith のようなフルネームで入力し、検索タグがない場合は著者として検索されます。完全な著者名は、julia s wong または wong julia s のように、自然順または倒置順の両方で検索可能です。

ジャーナルによる検索を行いたい

ジャーナルによる検索を行いたいときは、検索ボックスに以下のいずれかを入力してください。
ジャーナルタイトル(例:Molecular biology of the cell)
タイトルの略称(例:mol biol cell)
ISSN番号(例:1059-1524)

出版日による検索を行いたい

出版日による検索を行いたいときには、詳細検索をクリックし、検索ビルダーを使用します。
すべてのフィールドメニューから日付フィールドを選択し(例:日付 - 出版)、空欄に単一の日付または日付範囲を入力します。「現在」日付ボックスには何も入力しないと、現在の日付までの日付で検索されます。
クエリボックスに日付を追加することでも出版日による検索を行えます。クエリボックスへ用語を追加し「検索」(または「履歴に追加」)をクリックし検索を実行できます。
検索ボックスでは単一日付による検索も行えます。その場合は、yyyy/mm/dd [日付フィールド] の形式で日付を入力します。

出版日と他の検索語の組み合わせ

出版日と他の検索語を組み合わせる場合は、ブール演算子を使用します。例えば、ブール演算子 AND を使用して、検索対象を特定の出版日に限定できます。cancer AND 2020/06/01[dp]

フィルタを使用して、論文タイプ、テキストの有無、出版日、言語、性別、年齢などで検索結果を絞り込むことができます。
フィルタを適用するにはPubMed で検索を実行し、サイドバーから有効にしたいフィルタをクリックします。
選択したフィルタをオフにするか、ブラウザのデータがクリアされるまで、以降の検索はフィルタリングされます。
人気のあるフィルターは、デフォルトでサイドバーに含まれています。適用されているすべてのフィルターをオフにするには、「すべてクリア」リンクまたは「すべてのフィルターをリセット」ボタンをクリックします。

フクロウは、夜行性で、暗闇の中でも物を見ることができます。
PubMedを活用すると暗闇を照らすことができます。

論文の種類で絞り込みたい

論文の種類を選択すると、その論文が示す資料の種類に基づいて検索結果を絞り込むことができます。Clinical Trial(臨床試験)、Review(総説)などが選択できます。
Additional Filtersボタンを使用して、サイドバーに論文タイプを追加できます。PubMedに掲載されている論文タイプの全リストが利用できます。

出版日の範囲で検索結果を絞り込みたい

出版日の範囲で検索結果を絞り込むには、1年、5年、10年をクリックするか、カスタム範囲を入力します。これらのフィルタには、電子版と印刷版の両方の出版日が含まれます。

年齢グループで絞り込みたい

年齢フィルターで、ヒトの研究結果を特定の年齢グループに絞り込むことが出来ます。年齢フィルターはAdditional Filters ボタンを使用してサイドバーに追加できます。年齢フィルターには以下が含まれます
小児:出生~18歳
新生児:生後1ヶ月
乳児:生後23ヵ月
幼児:1~23ヶ月
未就学児:2~5歳
幼児:2~5歳 6~12歳
青年:13~18歳
成人:19歳以上
ヤングアダルト:19~24歳
成人:19~44歳
中年+高齢者 45歳以上
中年:45歳以上 45~64歳
高齢者 65歳以上
80歳以上 80歳以上

フクロウは知恵や洞察力のシンボルとしても知られています。
PubMedは医学・生物学研究を行う上で研究者や医療従事者に重要な情報を提供しています。

フィールド毎に絞り込みたい

  • 検索フィールドタグを使うと様々なフィールド毎に絞り込み検索を行うことが出来ます。角括弧で囲むことで検索フィールドタグを指定できます。検索フィールドタグは大文字でも小文字でも大丈夫です。検索フィールドタグはAutomatic Term Mapping (ATM)をオフにし、検索対象を指定された用語のみに限定します。例えば、kidney allograft[tiab] のように複数の用語の後に検索フィールドタグを使用すると、それらの用語をフレーズとして検索してしまいますので、同じフィールドで複数の用語を検索するには、例えば covid-19[ti] vaccine[ti] children[ti] のように、各用語に個別のタグを付ける必要があります。Advanced Searchビルダーを使用すると、特定のフィールドの用語を検索したり、大規模で複雑な検索文字列を作成したりすることができます。検索フィールドタグには、以下のようなタグがあります。

  • 所属 [ad]

  • すべてのフィールド [all]

  • 記事識別子 [aid]

  • 著者名 [au]

  • 著者識別子 [auid]

  • 書籍 [book]

  • コメント修正タイプ

  • 完了日 [dcom]

  • 利益相反声明 [cois]

  • 企業著者 [cn]

  • 作成日 [crdt]

  • EC/RN番号 [rn]

  • 編集者 [ed]

  • 入力日 [edat]

  • フィルター [filter] [sb]

  • 最初の著者名 [1au]

  • 完全な著者名 [fau]

  • 完全な研究者名 [fir]

  • 助成金と資金提供 [gr]

  • 研究者名 [ir]

  • ISBN [isbn]

  • 号 [ip]

  • ジャーナル [ta]

  • 言語 [la]

  • 最後の著者名 [lastau]

  • ロケーションID [lid]

  • MeSH 日付 [mhda]

  • MeSHメジャートピック [majr]

  • MeSH小見出し [sh]

  • MeSH用語 [mh]

  • 修正日 [lr]

  • NLMユニークID [jid]

  • その他の用語 [ot]

  • 所有者

  • ページネーション [pg]

  • 被験者としての個人名 [ps]

  • 薬理作用 [pa]

  • 出版地 [pl]

  • PMCIDとMID

  • PMID [pmid]

  • 出版日 [dp]

  • 出版タイプ [pt]

  • 出版社 [pubn]

  • 二次情報源ID [si]

  • サブセット [sb]

  • 補足概念 [nm]

  • 本文の単語 [tw]

  • タイトル [ti]

  • タイトル/抄録 [tiab]

  • 音訳タイトル [tt]

  • ボリューム [vi]

クロウは夜行性であり、学者や研究者が夜遅くまで勉強や研究に没頭する姿とも重なります。

まとめ

これから始まる研究活動においてPubMedは欠かせないツールです。
研究はしばしば難しく、時には答えが見つからないこともあります。しかし、PubMedのようなリソースを駆使することで、あなたの探求はより明確で、効率的なものになります。
PubMedは、世界中の研究者たちと知識を共有し、新しいアイデアを探求するための窓口となります。疑問を抱いた時、新しい発見を求めた時、またはインスピレーションを求める時、PubMedは常にそこにあります。
これからの研究生活で直面する挑戦は多いかもしれませんが、情報を探求し、知識を深めることで、それらの挑戦を乗り越え、学術界に足跡を残すことができるでしょう。
PubMedを活用して、皆さんの研究がより充実したものになることを願っています。


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