大和総研がこんなレポートを出すなんて面白い・・。

＊カンボジア・アンコールワット（シェムリアップ）
＊インドネシア・ボロブドゥール（ヨグヤカルタ）
＊ミャンマー・バガン（ニャウンウー）
ですかね。もちろんすべて行ったことがありますが。

地理的に言えば、この３点を結べば、最適なハブ空港はシェムリアップと言う事にはなりますが・・。
と言う事なので、カンボジア政府に働きかけるのが先で、その後インドネシア・ミャンマー（そしてタイランド）と向かうと良いのではないでしょうか？
（因みに、カンボジアのみ、アセアンの中では「ビザなし」渡航が日本人は出来ないので（ミャンマーは現在試験導入中）、そこの外交努力も未だ必要だろうなと。）

追記：
「遠距離路線」と言う表現がよくわからん・・。例えば、カンボジアのシェムリアップ空港をハブに（基軸に）するなら、ミャンマー・ニャウンウー空港やインドネシア・ヨグヤカルタ（ジョグジャカルタ）空港は、２～３時間レベルです。「那覇」＜＞「成田」などのレベルにすぎないと思う。

（写真：ミャンマー・バガンにて 2017年10月12日）