宿主内での選択圧力がウイルス進化を促すことはなく、したがって、高度にCOVID-19ワクチンを接種された集団におけるSARS-CoV-2変異株出現に相関するものではない

リンクの論文(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10063955/)が示そうとすることとは異なり、特に、急性自己限定性感染を引き起こすウイルスに対して集団ワクチン接種を実施したという文脈で、もしくは、その後の、例えば、オミクロンによって引き起こされたような、ワクチン・ブレークスルー感染の文脈においてSARS-CoV-2の宿主内多様性を研究することは、必ずしもウイルス進化を探索する科学的に確実なアプローチとは言えない。

高度にCOVID-19ワクチンを接種された集団では、急性自己限定性感染を引き起こすウイルスの進化の軌跡と動態は、接種された個々の宿主ではなく、主としてワクチン接種された集団全体によってウイルスの感染性と伝播性におよぼされる免疫選択圧力によって形成される。言い換えれば、宿主内の変異率は、集団ワクチン接種、あるいは、蔓延するワクチン・ブレークスルー感染の影響を反映しない。オミクロンによるワクチン・ブレークスルー感染で生み出された交差性中和抗体はスパイクタンパク質内のより保存された抗原部位を標的とするため、それぞれのCOVID-19ワクチン接種者内の変異率を制約する一方で、高度にCOVID-19ワクチンを接種された集団で、集団レベルの大規模な免疫逃避を引き起こす。

ウィルスに対する集団レベルの免疫選択圧力は、集団免疫が確立されない限り持続する。

結論を言えば、オミクロンの出現以来、集団内の選択圧力が、高度にCOVID-19ワクチンを接種された集団での多様な免疫逃避変異株の大規模な出現と同時流行を引き起こしている。