COVID-19情報:2023.03.24

皆様

本日のCOVID-19情報を共有します。

本日の論文は、Lancet系より5編、JAMA、Natureより各1編です。
Lancetの1篇目は、SARS-CoV-2感染者の無症候性COVID-19の発症を予防するための抗COVID-19超免疫免疫グロブリン20%(C19-IG20%)の皮下の安全性と有効性をプラセボと比較評価した研究です。SARS-CoV-2感染者の無症状者にヒト超免疫免疫グロブリンC19-IG20%を皮下投与することは安全であるが、症候性のCOVID-19の発症を防ぐことはできないことが示唆されました。
2編目は、侵襲的または非侵襲的な機械的換気を必要とする重症COVID-19で入院した患者において、末端補体C5阻害剤であるravulizumabの安全性および有効性を評価した研究です。BSC(Best Supportive Care)にravulizumabを追加しても、生存期間やその他の副次的アウトカムは改善しませんでした。
3編目は、ブースターワクチン接種を受け、検査と隔離の義務に従う意思を評価するために行った多国籍調査の論文です。隔離の義務付けをよりシンプルにすることで、感染症対策に妥協することなく、認知度や実際のコンプライアンスを高め、検査コストを削減することができるとのことです。
4編目は、重症COVID-19に対するサリルマブ(COVID-19への使用が提案されているインターロイキン-6阻害剤の一種)の有効性と安全性を検討した研究です。
重症COVID-19に対するサリルマブの有効性は、全体でも重症度別解析集団でも実証されませんでした。
5編目は、COVID-19の規模や長期にわたる後遺症としての、フレイル(虚弱)を含む長期的な転帰について検証した英国の研究です。5ヶ月から12ヶ月の間にフレイルの改善はみられましたが、3分の2はプレフレイルまたはフレイルのままでした。

JAMA論文では、PCC(Post−COVID-19 Condition)の発症リスクの増加と関連することが判明している人口統計学的特性および併存疾患を評価することを目的としたシステマティックレビューとメタ解析論文です。この系統的レビューとメタ解析により、特定の人口統計学的特性(例:年齢と性別)、併存疾患、および重度のCOVID-19がPCCリスクの上昇と関連する一方、ワクチン接種はPCC後遺症の発症に対して予防的役割を持つことが示されました。

Natureは、人獣共通感染症の宿主としてのコウモリの研究に関するNatureのNews Feature記事です。非常に貴重な知見がまとめられています。
人獣共通感染症を取り巻く様々のウイルスとコウモリとの関係が明らかになってきました。コウモリの免疫力は、非常に示唆に富むものであり、次なるパンデミックに備えての投資として、研究を深めておく意義は十分にありそうです。

報道に関しては、「アドバイザリーボード」によるパーティション再使用の推奨とも取れる発言が一番の問題です。
「アドバイザリーボード」の脇田氏が記者会見で「パーティションを今後、外す場面も出てくるが、感染状況が高まれば、また活用してもらう場面もあるのではないか」と述べたとのことです。パーティションに関しては、権威あるScience誌でその使用リスクが指摘されています。
「パーティション設置が感染を予防した」という実証的な研究がなく、しかも権威ある学術誌がリスクを指摘している中でなぜパーティションの使用を推奨するのか、理解に苦しみます。

高橋謙造

1)論文関連      
Lancet
Subcutaneous anti-COVID-19 hyperimmune immunoglobulin for prevention of disease in asymptomatic individuals with SARS-CoV-2 infection: a double-blind, placebo-controlled, randomised clinical trial

*SARS-CoV-2感染者の無症候性COVID-19の発症を予防するための抗COVID-19超免疫免疫グロブリン20%(C19-IG20%)の皮下の安全性と有効性をプラセボと比較評価した研究です。
2021年4月28日から12月27日の間に5日以内にSARS-CoV-2感染が確認された無症状のワクチン未接種の成人(18歳以上)を対象に、多施設共同無作為化二重盲検プラセボ対照試験を実施しました。参加者は、C19-IG20%を1gまたは2g添加した10mLを盲検下で皮下注入する群と、プラセボとして同量の生理食塩水を投与する群に無作為に割り付けられました(1:1:1)。
主要評価項目は、輸液後14日目まで無症状を維持した参加者の割合としました。副次的評価項目は、酸素補給、医療機関への通院、入院、ICUを必要とした人の割合、鼻咽頭スワブにおけるウイルス量の減少およびウイルスクリアランスでした。安全性は、有害事象が発生した患者の割合で評価されました。2021年12月に実施された計画的な中間解析において、対象集団にベネフィットの可能性がないため、本試験は早期終了となりました。
461人(平均年齢39.6歳[SD 12.8])が無作為化され、SARS-CoV-2検査陽性から平均3.1日(SD 1.27)以内に介入を受けました。皮下輸液を受けた参加者のみを対象とした事前指定修正intention-to-treat解析では、主要転帰は、1gのC19-IG20%を投与された参加者の59.9%(91/152人)、64. 7%(99/153人)、2gを投与された参加者、およびプラセボを投与された参加者63.5%(99/156人)で発生しました(割合の差 1g C19-IG20% vs. プラセボ、-3.6%;95%CI -14.6%~7.3%,p=0.53;2g C19-IG20% vs プラセボ、1.1%;-9.6-11.9,p=0.85)。副次的臨床効果評価項目およびウイルス学的評価項目はいずれも試験群間で有意な差はありませんでした。有害事象発生率は各群で同程度であり、治験薬注入に関連した重篤な有害事象や生命を脅かす有害事象は報告されませんでした。
今回の結果から、SARS-CoV-2感染者の無症状者にヒト超免疫免疫グロブリンC19-IG20%を皮下投与することは安全であるが、症候性のCOVID-19の発症を防ぐことはできないことが示唆されました。

Intravenous ravulizumab in mechanically ventilated patients hospitalised with severe COVID-19: a phase 3, multicentre, open-label, randomised controlled trial

*侵襲的または非侵襲的な機械的換気を必要とする重症COVID-19で入院した患者において、末端補体C5阻害剤であるravulizumabの安全性および有効性を評価した研究です。
この第3相多施設共同オープンラベル無作為化比較試験(ALXN1210-COV-305)には、フランス、日本、スペイン、英国、米国の31の病院から成人患者(18歳以上)が登録されました。
対象となった患者は、SARS-CoV-2と確定診断され、入院と侵襲的または非侵襲的な機械的換気が必要で、CTスキャンまたはX線により重症肺炎、急性肺損傷、急性呼吸窮迫症候群が確認された患者でした。ウェブベースの対話型応答システムを用いて、参加者をravulizumab静注+最善の支持療法(BSC: Best Supportive Care)またはBSC単独投与にランダムに割り付けられました(2:1)。無作為化は、挿管状態によって層別化され、6ブロックの順列化で行われました。ravulizumabは、1日目、5日目、10日目、15日目に体重に応じた量の静脈内投与が行われました。有効性の主要評価項目は、intention-to-treat(ITT)集団における29日目の全死因死亡率に基づく生存率としました。安全性評価項目は、ravulizumab+BSC群でravulizumabを少なくとも1回投与された無作為に割り付けられたすべての患者、およびBSC群で無作為に割り付けられたすべての患者において分析されました。本試験は、無益性により中間解析で終了しました。
2020年5月10日から2021年1月13日の間に、202名の患者さんが試験に登録され、ravulizumab+BSCまたはBSCにランダムに割り当てられ、201名の患者さんがITT集団に含まれました(ravulizumab+BSC群135名、BSC群66名)。ravulizumab+BSC群は男性96名(71%)、女性39名(29%)、平均年齢63.2歳(SD 13.23)、BSC群は男性43名(65%)、女性23名(35%)、平均年齢63.5歳(12.40)でした。ほとんどの患者(ラブリズマブ+BSC群135例中113例[84%]、BSC群66例中53例[80%])は、ベースライン時に侵襲的機械換気を行っていました。マルチプルインピュテーションに基づく全生存率の推定値は、ravulizumab+BSC投与群で58%、BSC投与群で60%でした(Mantel-Haenszel解析:リスク差-0.0205;95%CI -0.1703~0.1293; 片側p=0.61)。安全性集団では、ravulizumab+BSC群127例中113例(89%)、BSC群67例中56例(84%)に治療上緊急の有害事象が発生しました。これらの事象のうち、感染症および長期感染(73[57%]対24[36%]患者)および血管障害(39[31%]対12[18%])は、BSC群よりもravulizumab+BSC群でより頻繁に観察されました。ravulizumabに関連すると考えられる重篤な有害事象が5名の患者に発生しました。これらの事象は、菌血症、血小板減少、食道出血、クリプトコッカス性肺炎、発熱(各1名)でした。
BSCにravulizumabを追加しても、生存期間やその他の副次的アウトカムは改善しませんでした。安全性に関する所見は、承認された適応症におけるravulizumabの既知の安全性プロファイルと一致しました。有効性の欠如にもかかわらず、本研究は、重症患者においてC5阻害が達成可能であることを示すことにより、重症患者における補体治療に関する今後の研究に価値を与えるものであるとのことです。

Attitudes towards booster, testing and isolation, and their impact on COVID-19 response in winter 2022/2023 in France, Belgium, and Italy: a cross-sectional survey and modelling study

*ブースターワクチン接種を受け、検査と隔離の義務に従う意思を評価するために行った多国籍調査の論文です。
調査データと推定免疫力データを分岐過程の流行拡大モデルに統合し、フランス、ベルギー、イタリアにおける冬波を管理するための現行プロトコルの有効性とコストを評価しました。
調査参加者(N = 4594)の大多数は、3カ国を通じて検査(91%以上)と迅速隔離(88%以上)を遵守する意思がありました。
また、ブースターワクチン接種の遵守を宣言したシニア層の割合には顕著な違いが見られました(フランス73%、ベルギー94%、イタリア86%)。
疫学モデルの結果、検査と隔離のプロトコルは、この遵守が行われれば、伝播の低減に大きな利益をもたらすと推定されました(17~24%の低減、フランスとベルギーではR = 1.6からR = 1.3 に、イタリアではR = 1.2 に)。フランスのプロトコルと同様の軽減レベルの達成には、ベルギーのプロトコルは、35%少ない検査(感染者1人当たり1検査から0.65検査)で十分であり、イタリアのプロトコルの長い隔離期間(平均6日対11日)を避けることで達成できました。
フランスとベルギーでは、検査に費用がかかるとアドヒアランスが著しく低下し、プロトコルの有効性が損なわれることが分かりました。
隔離の義務付けをよりシンプルにすることで、感染症対策に妥協することなく、認知度や実際のコンプライアンスを高め、検査コストを削減することができます。ブースターワクチン接種率の高さは、冬将軍を抑制するための重要なポイントです。

Sarilumab plus standard of care vs standard of care for the treatment of severe COVID-19: a phase 3, randomized, open-labeled, multi-center study (ESCAPE study)

*重症COVID-19に対するサリルマブ(COVID-19への使用が提案されているインターロイキン-6阻害剤の一種)の有効性と安全性を検討した研究です。
イタリアの5つの病院で実施されたこの第3相非盲検無作為化臨床試験では、重度のCOVID-19肺炎(機械的人工呼吸器を除く)の成人を、サリルマブ静注(400mg、12時間後に反復投与)+標準治療(SOC: Standard of Care)群(A群)またはSOC継続群(B群)の2:1無作為に割り付けました。
無作為化はウェブ上で行われ、事後解析として、参加者はベースラインの炎症パラメータによって層別化されました。
主要評価項目は、いずれかの試験治療(サリルマブまたはSOC)を受けた無作為化患者全員を含む、修正Intention-To-Treat集団で分析されました。
主要アウトカムは、ベースラインから30日目までに、7段階の序列スケールで2ポイントの臨床的改善が見られるまでの時間でした。
主要アウトカムを2群間で比較するためにKaplan Meier法とログランク検定を用い、ハザード比(HR)を推定するために、臨床センターで層別化し、重症度で調整したCox回帰を使用しました。
2020年5月から2021年5月にかけて、191名の患者が適格性を評価され、そのうち脱落者9名を除く176名がA群(121名)およびB群(55名)に割り付けられました。30日目では、主要評価項目に有意差は認められませんでした(A群88%[95%CI 81-94]対B群85%[74-93]、HR 1.07[0.8-1.5];log-rank p=0.50)。
炎症パラメータで層別化した結果、C反応性蛋白(CRP)<7mg/dLの層では、統計的有意差はないが、アームAはBより高い改善確率を示しました(88%[77-96] vs 79%[63-91], HR 1. 55 [0.9-2.6]; log-rank p = 0.049)、リンパ球<870/mmc(90% [79-96]) vs (73% [55-89], HR 1.53 [0.9-2.7]; log-rank p = 0.058) の区間では、統計的有意差は認められませんでした。全体として、AEはA群で39/121(32%)、B群で14/55(23%)が報告され(p = 0.195)、重篤なAEはそれぞれ22/121(18%)、7/55(11%)でした(p = 0.244) 。なお、治療関連死はありませんでした。
重症COVID-19に対するサリルマブの有効性は、全体でも重症度別解析集団でも実証されませんでした。探索的解析では、CRP値が低い患者やリンパ球数が少ない患者のサブセットがサリルマブ治療で利益を得た可能性が示唆されたが、この知見は他の研究での再現が必要でしょう。また、副腎皮質ステロイドの併用率が比較的低いことも、今回の結果を部分的に説明できるかもしれないとのことです。

Prevalence of physical frailty, including risk factors, up to 1 year after hospitalisation for COVID-19 in the UK: a multicentre, longitudinal cohort study

*COVID-19の規模や長期にわたる後遺症としての、フレイル(虚弱)を含む長期的な転帰について検証した英国の研究です。
この前向きコホート研究は、英国の35の施設(PHOSP-COVID)において、臨床的にCOVID-19と診断された入院生活を生き延びた成人を募集しました。
フレイルの負担は、Fried's Frailty Phenotype(FFP)を用いて客観的に測定されました。
主要アウトカムは、退院後5ヶ月および1年における各FFP群(ロバスト(FFP基準なし)、プレフレイル(FFP基準1~2つ)、フレイル(FFP基準3つ以上)の有病率でした。
一次解析に含めるには、参加者は5つのFFP基準のうち3つの基準について完全なアウトカム・データを得る必要がありました。入院後5ヶ月と1年におけるフレイル領域の縦断的な変化と、フレイル状態の危険因子が報告されています。患者が感じる回復と健康関連QOL(HRQoL)は、COVID-19以前はレトロスペクティブに、5ヶ月と1年の診察時にはプロスペクティブに評価されました。
2020年3月5日から2021年3月31日の間に、FFPデータを持つ2419人の参加者が登録されました。平均年齢は57.9(SD 12.6)歳、933人(38.6%)が女性、429人(17.7%)が侵襲的機械換気を受けたことがありました。1785人が両時点で測定を行っており、そのうち240人(13.4%)、1138人(63.8%)、407人(22.8%)がそれぞれ5ヵ月後にフレイル、プレフレイル、頑健であるのに対し、1年後は123人(6.9%)、1046人(58.6%)、616人(34.5%)でした。プレフレイルまたはフレイルに関連する要因は、侵襲的な機械換気、高齢、女性、社会的困窮の大きさでした。フレイル参加者は、COVID-19発病前と比較してHRQoLの低下が大きく、自分を回復したと表現する割合も低いという結果でした。
COVID-19による入院後、身体的な虚弱や虚弱予備軍はよく見られますが、5ヶ月から12ヶ月の間にフレイルの改善はみられましたが、3分の2はプレフレイルまたはフレイルのままでした。このことから、総合的な評価と、初期疾患以外のプレフレイルティやフレイルティを対象とした介入が必要であることが示唆されます。

JAMA
Risk Factors Associated With Post−COVID-19 Condition A Systematic Review and Meta-analysis

*PCC(Post−COVID-19 Condition)の発症リスクの増加と関連することが判明している人口統計学的特性および併存疾患を評価することを目的としたシステマティックレビューとメタ解析論文です。
MedlineおよびEmbaseデータベースを、開始時から2022年12月5日まで系統的に検索し、メタ解析では、成人(≧18歳)患者におけるPCCの危険因子および/または予測因子を調査したすべての発表研究を対象としました。
データの抽出と統合に関して、各危険因子のオッズ比(OR)は、選択した研究からプールされました。各危険因子について、ランダム効果モデルを用いて、危険因子を持つ人と持たない人の間でPCC発症リスクを比較しました。データ解析は、2022年12月5日から2023年2月10日まで実施しました。
PCCの危険因子として、患者の年齢、性別、体重(キログラム)を身長(メートル2乗)で割った体格指数、喫煙状況、不安および/またはうつ病、喘息、慢性腎臓病、慢性閉塞性肺疾患、糖尿病、免疫抑制、虚血性心疾患などの合併症、以前のCOVID-19による入院またはICU(集中治療室)入院、過去のCOVID-19に対するワクチン接種等を設定しました。
最初の検索で5334件のレコードが得られ、そのうち255件の論文がフルテキスト評価を受け、41件の論文と対象となった合計860,783人の患者が特定されました。メタ解析の結果、性別が女性(OR, 1.56; 95% CI, 1.41-1.73)、年齢(OR, 1.21; 95% CI, 1.11-1.33)、高いBMI(OR, 1.15; 95% CI, 1.08-1.23)、および喫煙 (OR, 1.10; 95% CI, 1.07-1.13) とPCC発症リスク増加が関連していたことがわかりました。また、併存疾患の存在や入院・ICU入室の既往は、PCC発症の高リスクと関連することが判明しました(それぞれOR, 2.48; 95% CI, 1.97-3.13, OR, 2.37; 95% CI, 2.18-2.56, )。COVID-19を2回接種した患者は、接種していない患者と比較してPCC発症リスクが有意に低いという結果でした(OR、0.57、95%CI、0.43-0.76)。
この系統的レビューとメタ解析により、特定の人口統計学的特性(例:年齢と性別)、併存疾患、および重度のCOVID-19がPCCリスクの上昇と関連する一方、ワクチン接種はPCC後遺症の発症に対して予防的役割を持つことが示されました。これらのエビデンスは、PCCを発症する可能性のある人についてのより良い理解を可能にし、ワクチン接種の利点を示す新たなエビデンスを提供するものと考えられるとのことです。

Bats live with dozens of nasty viruses — can studying them help stop pandemics?

*SARS-CoV-2の発生以来、より盛んになったコウモリの研究に関するNatureのNews Feature記事です。
昨年アメリカで開催されたあるシンポジウムでは、パンデミック以前に開催された同じイベントと比較して、参加者が30%増加し、資金提供者はコウモリと感染症の研究に資金を投入しているそうです。
特に注目されるのはコウモリの免疫システムで、エボラ出血熱からニパ、重症急性呼吸器症候群(SARS)まで、人間や他の哺乳類にとって致命的なウイルスへの耐性が注目されています。コウモリの免疫力はあまり理解されていませんが、その結果は明らかで、コウモリがヒトのさまざまな壊滅的なウイルス感染の原因になっていると考えられています。
この分野は、パンデミックの影響もあり、現在、変曲点を迎えている。何十年もかけてコウモリの感染症を研究してきた研究者と熱心な新参者が、コウモリがこのような危険な病原体と共存できるのか、という疑問に新しいツールを開発し、適用しています。このような洞察が、いつか人の感染症に対処するための治療法や、コウモリからウイルスが流出するのを防ぐ方法につながると期待する人もいます。
◯コウモリの一般的特徴
・コウモリは標準的な実験用マウスに比べ、妊娠期間が長く、仔コウモリの数も少ない。
・世界中の1,450種以上のコウモリのうち、研究用コロニーで飼育されているのはほんの一握りであり、野生のコウモリを捕獲するには、物流や安全面で問題があり、また、コウモリの細胞は細胞培養で増殖させるのが難しいことで知られている。
・他の実験動物に使用されているツールキットの中には、コウモリに欠けているものもあり、免疫学者が免疫細胞やタンパク質にタグを付けるために使用するモノクローナル抗体が不足している。長い間、コウモリの種の高品質なゲノムは存在しなかった。マウスやヒトの組織で研究している免疫学者たちは、このようなツールにアクセスできる。
・ツールがないために、研究者はいまだに『コウモリの免疫系の基本的な構造』を明確に把握できていない。
・しかし、既存の研究者による長年の研究と新参者の参入により、高品質のゲノムや実験室で作られたコウモリの組織など、新しいツールや手法が生み出されている。
・コウモリの研究費も増えており、研究論文も増えている。学術データベース「Dimensions」によると、免疫学の論文におけるコウモリへの言及は、2018年の約400件から2021年には1,500件と、3倍以上に増えている。あるスタートアップ企業は、コウモリの研究から得た知識を利用して、がんから炎症、老化に至る疾患の治療法を開発することを目指し、ベンチャーキャピタルから1億米ドルの資金を調達した。
・最新の研究では、コウモリの免疫反応を支える生物学的メカニズムの詳細が明らかになりつつあり、その中には、コウモリに特有の細胞タイプの特定も含まれている。また、コウモリの種がウイルス感染に耐える方法が多様であることも解明されつつある。
◯ここ数十年、コウモリが脚光を浴びているのは、豊富なウイルスを宿すという特性である。
・ある種のコウモリ、特にカブトコウモリは、SARS-CoV-2に近縁なコロナウイルスを含む、非常に多様なウイルスを宿すことができる。また、狂犬病、エボラ出血熱、マールブルグなどのウイルスを宿す種もある。コウモリのゲノムには、ウイルスの残骸がちりばめられている。
・コウモリが、感染の兆候を見せずにウイルスに耐えることができるのはなぜなのだろうか。
研究によると、コウモリの中には、侵入者に対して強固な第一防御を行う種があることが判明している。
異物の脅威がない場合でも、ある種のコウモリはインターフェロン(ウイルスを無効化するために警報を発し、努力を重ねる分子)を高レベルで維持しており、これによりウイルスの複製を迅速に停止させることができる。コウモリはまた、ウイルスの複製を妨害したり、ウイルスが細胞から出るのを止めたりするタンパク質をコードする遺伝子のレパートリーを広げている。また、コウモリの細胞は、オートファジーと呼ばれる損傷した細胞成分を処理する効率的なシステムを備えており、これはヒトの細胞からウイルスを除去するのに役立つことが示されている。
・病原体が侵入してきても、コウモリは通常、感染症によるダメージの多くを占めることが多い過剰な炎症反応を起こさない。コウモリは、炎症反応を抑制する方法をいくつか持っており、例えば、「インフラマソーム」と呼ばれる大きな多タンパク質分子の活動を抑制する方法がある。ウイルスを完全に駆除するために膨大なエネルギーを費やすのではなく、低レベルのウイルスの存在に耐えているようである。「コウモリと病原体の間には、平和条約のようなものがある」
・コウモリの防御に関して、迅速かつ無差別に行われる自然免疫反応だけでなく、病原体に関する情報を保持し、再び敵に遭遇したときに行動を開始する、より緩やかで標的を絞った適応免疫反応にも関心が高まっている。
・コウモリがいつどこでウイルスを排出し、他の動物に感染する危険性をより深く理解するために、コウモリの免疫反応と生態の関連性を研究している研究者もおり、この研究により、コウモリにストレスを与える環境要因や、それによってウイルスの排出や拡散のリスクが高まるかどうかが明らかになるかもしれない。
◯コロナウイルス宿主としてのコウモリから得られた知見
・コロナウイルスを宿すコウモリは、北米ではあまり見かけないが、ヨーロッパにはたくさんいる。
・他の生物種では生物学や病気の研究に当たり前のように使われる幹細胞だが、コウモリの場合は難しい。この人工多能性幹細胞(iPS細胞)は、2月に『Cell』誌に掲載されたが、すでにコウモリとウイルスの密接な進化的関係に関する興味深い知見を明らかにしている。
・これらの細胞が発現するRNAの塩基配列を決定したところ、本質的にウイルス断片である部分が豊富に見つかり、その多くはもともとコロナウイルスゲノムであった。ウイルス遺伝子の発現は、コウモリの皮膚細胞やマウスやヒトの多能性細胞よりも、多能性細胞の方が高く、多様であった。しかも、多能性コウモリ細胞は、実際にウイルス断片を利用して、ウイルス様粒子と思われるものを作っていた。
・コウモリの幹細胞を作ると、基本的に「ゲノムの中にある化石化したウイルスをすべて目覚めさせ」、この細胞は、ゲノムの中にあるウイルスの情報を系統的に吸い上げ、「まるでスポンジのように」、それを発現するようだ。このため、コウモリの細胞はウイルスにとって好都合な環境になっている。しかし、このことが、コウモリがウイルスと共存する術を身につけたことを意味するのかどうかは、まだ明らかではない。一つの可能性は、遺伝子の挿入によって、ワクチンと同じように、ウイルス感染による悪影響からコウモリを守ることができることだ。
◯1,000ゲノム
・細胞生物学者にとって細胞や組織と同様に、最も重要なリソースのひとつが、ゲノムである。2020年以前、コウモリのゲノムは約12種類あり、その質はまちまちであった。
・「Bat1K」と呼ばれる世界的なゲノムコンソーシアム(すべてのコウモリの種について高品質なゲノムを作成することを目的としていた)によって、それぞれが異なる属に属し、タンパク質コード遺伝子が明確にタグ付けされた6種のコウモリについて、初めて高品質のゲノムを発表した。また、パンデミック以降、バイオテクノロジー企業などからの関心と資金提供が急増し、これまでに約80種類のコウモリのゲノム配列が決定された。
・高品質のゲノムを入手できるようになったことで、コウモリの免疫学は大きく変化した。RNA分子やタンパク質の大規模な研究が容易になり、免疫細胞を分類する方法ができたことで、モノクローナル抗体の不足をある程度克服することができ、このゲノムが、多くの研究の基礎となる可能性がある。
・Bat1Kコンソーシアムでは、SARS-CoV-2の最も近縁とされる宿主である中国カブトコウモリ(Rhinolophus sinicus)のコレクションが拡大された。その結果、新たに10個のゲノムが解読され、そのうち4個はカブトコウモリ科のものであった。2月7日付けのプレプリントで、Irving、Teelingらは、コウモリのゲノムには、免疫や代謝に関わる遺伝子が他の哺乳類よりも多く、正の選択を受けていることを発表した。この遺伝子は、人のSARS-CoV-2感染時に観察される過剰炎症に重要な役割を果たす抗ウイルスタンパク質を発現するISG15という遺伝子の1つを詳しく調べた。細胞実験では、このタンパク質のライノロフィド型とカバシデリッド型に、他のほとんどの哺乳類に見られるアミノ酸が欠けていることを発見した。この変化は、タンパク質が細胞から離れるのを防ぎ、おそらくタンパク質が炎症反応を引き起こすのを防いでいるようである。このようなタンパク質は、コウモリが致命的なウイルスと共存するための重要な手がかりとなり、人間の治療法にも影響を与える可能性がある。
・高品質なゲノムを利用した最新の技術として、シングルセルRNAシーケンスがある。これは、研究者が興味のある細胞を採取してそのRNA内容を分析し、細胞の構成要素とその働きを調べるものである。
・洞窟のコウモリに、この種によく見られるが病気にはならないウイルスであるPteropine orthoreovirusを感染させたところ、コウモリの肺細胞からは、T細胞を含む多くの免疫細胞や、見慣れない細胞の痕跡が検出された。
・現在のところ、コウモリの単一細胞研究のほとんどは、免疫細胞の活性を示すカタログに過ぎない。未発表の研究では、ジャマイカのフルーツバットにH18N11型A型インフルエンザウイルスを感染させ、どの細胞を標的とするかを調べた。その結果、このウイルスがマクロファージ(体をパトロールして病原体を食い止める免疫細胞)を標的にしていることがわかった。この単細胞実験により、研究者たちは、より詳細な細胞培養実験に向けた大きなスタートを切ることができた。少なくとも、どこから調べるべきかのヒントが得られた。
・他の科学者たちも、RNA配列決定法を用いてコウモリとヒトの細胞を比較している。さまざまな種のコウモリの細胞株でこの技術とCRISPR遺伝子編集を組み合わせて、コウモリと人間の細胞の自然免疫応答の違いを調べている研究もある。最終的には、ウイルスの複製を制御する遺伝子を特定するのが目的である。
・コウモリを丸ごと1匹使った研究としては、SARS-CoV-2の自然宿主ではないフルーツバットを、SARS-CoV-2に感染させることができるかどうかを検証しようとした実験がある。そこで、SARS-CoV-2が細胞内に侵入する際に使うACE2受容体を、コウモリの肺で発現させるウイルスベクターを用い、SARS-CoV-2を感染させた。その結果、コウモリはウイルスに特異的なTヘルパー細胞を産生することがわかった。この細胞は、適応的な標的免疫反応のキープレーヤーである。このTヘルパー細胞を刺激すると、炎症を制御することで知られる小さなタンパク質が生成され、コウモリの炎症反応が緩和されていることが説明できる。この成果は、2月9日にプレプリントとして掲載された。

2) 治療薬、 ワクチン関連       
国内     
温度管理誤ったコロナワクチン、1110人に接種 岡山県の医療機関
https://www.asahi.com/articles/ASR3N7FY7R3NPPZB004.html

海外     
米モデルナ、コロナワクチン価格を130ドルに引き上げ:日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXZQOGN22CKK0S3A320C2000000/

治療薬      

3)診断・検査、サーベイランス関連
変異株     

Long COVID
Who Is Most at Risk for Long Covid?
https://www.nytimes.com/2023/03/23/health/long-covid-risk-factors.html?smid=nytcore-ios-share&referringSource=articleShare
*今回まとめた、JAMA論文を下敷きにした記事で、わかりやすくまとまっています。
Long COVIDになる方のリスクを以下のようにまとめています。
◯女性
◯40歳以上
◯肥満
◯喫煙者
◯医療的介入を要する健康状態
・免疫抑制状態
・閉塞性肺疾患(COPD)
・虚血性心疾患
・喘息
・不安障害
・うつ
・慢性腎疾患
・糖尿病

国内        
インフル流行、収束見えず=「注意報」継続、報告数も増—専門家「6月まで警戒」
https://www.jiji.com/jc/article?k=2023032300661&g=soc
*「インフルエンザの流行が収まらない。定点医療機関当たりの患者報告数は、12日までの1週間で11.10人に上り、注意報レベル(同10人)を超えた状態が続く。報告数も約1カ月ぶりに増加しており、専門家は「6月ごろまでは警戒を」と呼び掛ける。」

「いばらきアマビエちゃん」 3月末で運用停止 感染発見例なし - 毎日新聞
https://mainichi.jp/articles/20230323/k00/00m/040/178000c
*「新型コロナウイルス感染者と接触した可能性がある人に通知を送る茨城県独自のシステム「いばらきアマビエちゃん」の運用が31日で止まり、「5類」移行の5月8日で終了する。県は登録と利用を県民と事業者に義務付けたが、通知をきっかけに感染が分かった事例はなかった。」

海外       

4)対策関連
国内      
コロナ対策パーテーション 専門家「効果と限界」指摘:日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUA23A1U0T20C23A3000000/
*「会話などによる飛沫が対面相手に飛ぶのを物理的に遮断する効果があることをふまえ、今後も不特定多数の人が集まる飲食の場での活用があり得るとした。エアロゾル感染の対策としては限界があるとして、こまめな換気の重要性を強調した。」
*パーティション、窓口や飲食の場で「今後も活用あり得る」専門家見解
https://www.asahi.com/articles/ASR3R6KVWR3RUTFL00N.html
*「見解では、パーティションに期待される役割は、口から出る飛沫(ひまつ)による感染対策だと指摘。今後も、窓口業務のように多くの人と対面で接する場、不特定多数が密集して飲食する場などで「飛沫を物理的に遮断するための活用はあり得る」とした。
 一方、コロナは、飛沫より小さく空気中を漂うエアロゾルからも感染する。パーティションではエアロゾルを十分に遮断できないとし、そのため、換気の徹底が重要だと指摘した。パーティションを撤去する場合、地域の流行が高まり再利用するときに備え、当面保管を考慮するよう求めた。」
*パーティション、飲食の場などで「今後も活用あり得る」専門家見解 - 毎日新聞
https://mainichi.jp/articles/20230323/k00/00m/040/261000c
*「見解では、パーティションの効果を「飛沫感染対策として有効であった」とする一方、「さまざまな対策が同時に行われた中で、どの程度、パーティション設置が対策に寄与したかを検証し、その効果を評価することは困難」と指摘。空気中を漂うウイルスを含んだ微粒子エアロゾルはパーティションで遮断できないとして、「こまめな換気が引き続き重要」としている。
「設置が不要な場面」は示さず、「当面、保管することを考慮されるとよい」とも言及。脇田氏は会合後の記者会見で「パーティションを今後、外す場面も出てくるが、感染状況が高まれば、また活用してもらう場面もあるのではないか」と述べた。」
*これらの記事に記載された見解には、疑義が拭えません。感染状況が高まった場合にパーティションを使用することは、感染リスクを高める可能性があるからです。

権威ある学術誌Science誌に掲載された以下のReview論文(ウイルスの空気感染を論じたもの)によれば、”Additionally,the physical plexiglass barriers designed
to block droplet spray from coughs and sneezes in indoor spaces can impede the airflow and even trap higher concentrations of aerosols in the breathing zone and has been shown to increase transmission of SARS-CoV-2 .(さらに、室内空間での咳やくしゃみによる飛沫を遮断するために設計された物理的なプレキシガラス製のバリアは、空気の流れを妨げ、さらに高濃度のエアロゾルを呼吸域に閉じ込めることがあり、SARS-CoV-2の感染を高めることが示されている。)”と明記されているからです(6ページ目に記載)。
Airborne transmission of respiratory viruses
https://www.science.org/doi/epdf/10.1126/science.abd9149
この議論の根拠論文は、やはりScience誌の以下の論文です。
Household COVID-19 risk and in-personschooling
https://www.science.org/doi/10.1126/science.abh2939
“By contrast, closing cafeterias and playgrounds and the use of desk shields are associated with lower risk reductions (or even risk increases);”

「パーティション設置が感染を予防した」という実証的な研究がなく、しかも権威ある学術誌がリスクを指摘している中でなぜパーティションの使用を推奨するのか、理解に苦しみます。

東京都北区と塩野義、高齢者施設の感染対策で連携協定:日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXZQOCC2341L0T20C23A3000000/

コロナ「5類」後も病床確保へ 大阪府、入院調整は縮小:日本経済新聞
https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUF2276Q0S3A320C2000000/

5類引き下げで食料支援など終了方針 山形県
https://www.asahi.com/articles/ASR3R6SZ3R3RUZHB005.html

海外       

5)社会・経済関連     
マスク着用を「内面化」した日本 外しやすくするには何が必要か
https://www.asahi.com/articles/ASR3N35G3R3FUPQJ00S.html

約76兆円のコロナ予算の行方。補助金の過大受給、ずさんな採択…無駄遣いの実態を追う #ldnews
https://news.livedoor.com/lite/article_detail/23920185/

コロナ感染者らを11日閉じ込め 東京の救護施設、都が検査 - 毎日新聞
https://mainichi.jp/articles/20230323/k00/00m/040/240000c

ワクチン大量廃棄の実情 菅氏「1日100万回」大号令も影響か - 毎日新聞
https://mainichi.jp/articles/20230317/k00/00m/040/382000c


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