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論文|オンライン公開中
微生物叢由来の酪酸はヒストン脱アセチル化酵素3を介して房細胞の分化を制限し、腸管2型免疫を調節する

https://www.cell.com/immunity/fulltext/S1074-7613(24)00027-X

エミリー・M・エシュレマン
テイラー・ライス
クリスタル・ポッター
リー・A・デンソン
フレッド・D・フィンケルマン
テレサ・アレンガット 8
すべての著者を表示

脚注を表示掲載:2024年1月30日DOI:https://doi.org/10.1016/j.immuni.2024.01.002

ハイライト

ヒトおよびマウスの房細胞増殖は微生物叢由来の酪酸によって抑制される

酪酸はヒストン脱アセチル化酵素3（HDAC3）を介して房細胞の動態を制御する

HDAC3は房細胞の過形成と抗ヘルペス2型免疫に必要である。

幹細胞内在性のHDAC3は腸房細胞の分化を指示する
まとめ
粘膜組織のタフト細胞は、2型免疫の重要な制御因子である。ここでは、腸の房細胞生物学に対する微生物叢の影響を調べた。タフト細胞および2型自然リンパ球のコハク酸誘導は、腸内細菌叢の消失とともに上昇した。酪酸産生菌のコロニー形成または酪酸処理により、この効果は抑制され、腸管ヒストン脱アセチル化酵素活性も低下した。エピジェネティック修飾酵素であるヒストン脱アセチル化酵素3（HDAC3）の上皮内欠失は、in vivoでの房細胞の増殖を抑制し、蠕虫感染時の2型免疫応答を障害した。酪酸は幹細胞から房細胞への分化を制限し、成体マウスおよびヒト腸管オルガノイドにおけるHDAC3の阻害は房細胞の拡大を阻害した。これらのデータを総合すると、幹細胞におけるHDAC3による房細胞分化のメカニズムが、常在性代謝産物によって抑制されることが明らかになり、微生物叢が腸管2型免疫を調整する経路が明らかになった。
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2型免疫
エピジェネティクス
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発生
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カーン I.S.
メッツガー T.C.
ポラックJ.L.
ら
胸腺房細胞はIL-4に富む髄質を促進し、胸腺細胞の発達を形成する。
Nature. 2018; 559: 627-631
論文で見る
スコープス (174)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
コタス M.E.
オリアリーC.E.
ロックスリー R.M.
タフト細胞： 保存された細胞系譜の文脈および組織特異的プログラミング。
Annu. Rev. Pathol. 2023; 18: 311-335
論文で見る
スコパス (5)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
デルジョルノ K.E.
ナイーム R.F.
ファンL.
チョン C.Y.
ラモス C.
ルータラ N.
オコナー C．
ハンター T.
マナー U.
ワールG.M.
タフト細胞の形成は膵損傷における上皮の可塑性を反映する： ヒト膵炎モデル化への示唆。
Front. Physiol.
論文で見る
スコープス (32)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
サキ-サルセスM.
キーリーT.
グロスA.
喬X.
エル＝ザータリ M.
グムシオ D.
サミュエルソンL.
マーシェントJ.
胃タフト細胞はDCLK1を発現し、過形成で増殖する。
Histochem. Cell Biol.
論文で見る
スコープス (86)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
マリカン S.E.
ガディスC.A.
アレンガットT.
ナイル M.G.
ジャコミンP.R.
エベレット L.J.
フェング D．
ステガー D.J.
シュグ J.
アーティスD．
ら
ヒストン脱アセチル化酵素3は、マクロファージのalternative activationにおけるエピゲノム上のブレーキである。
Genes Dev. 2011; 25: 2480-2488
論文で見る
(231件)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ラブM.I.
フーバーW.
Anders S.
DESeq2によるRNA-seqデータのフォルドチェンジと分散のモデレート推定。
ゲノム生物学 2014; 15: 550
論文で見る
論文掲載
PubMed
クロスレビュー
グーグル奨学生
ラングミードB.
トラプネルC.
ポップM.
サルツバーグ S.L.
ヒトゲノムに対する短いDNA配列の超高速かつ記憶効率の良いアラインメント。
ゲノム生物学 2009; 10: R25
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ドビンA.
デイビスC.A.
シュレシンジャーF.
ドレンコウ J.
ザレスキー C.
ジャ S．
バトゥット P.
シャイソン M.
Gingeras T.R.
STAR：超高速ユニバーサルRNA-seqアライナー。
Bioinformatics. 2013; 29: 15-21
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ハインツ S.
ベナーC.
スパン N.
ベルトリーノ E.
リン Y.C.
ラスロ P.
チェン J.X.
Murre C.
シン H.
グラス C.K.
系統決定転写因子の単純な組み合わせが、マクロファージとB細胞の同一性に必要なシス制御エレメントをプライミングする。
Mol. Cell. 2010; 38: 576-589
論文で見る
筑波大学
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
ロビンソン M.D.
マッカーシー D.J.
Smyth G.K.
edgeR：デジタル遺伝子発現データの差分発現解析のためのBioconductorパッケージ。
Bioinformatics. 2010; 26: 139-140
論文で見る
(株)昭文社(24436)
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
トルヴァルズドッティル H.
ロビンソンJ.T.
メシロフJ.P.
Integrative Genomics Viewer (IGV)： 高性能ゲノムデータの可視化と探索。
概要。Bioinform. 2013; 14: 178-192
論文で見る
スコープス(5506)
パブコメ
クロスリファレンス
グーグル奨学生
シャーマン B.T.
ハオ M.
Qiu J.
Jiao X.
Baseler M.W.
レーン H.C.
Imamichi T.
Chang W.
DAVID：遺伝子リストの機能濃縮解析と機能アノテーションのためのウェブサーバー（2021年更新）。
Nucleic Acids Res. 2022; 50: W216-W221
論文で見る
遺伝子発現情報
PubMed
クロスリファレンス
グーグル奨学生
マディソンB.B.
ダンバーL.
チャオ X.T.
ブラウンシュタイン K.
ブラウンシュタイン E.
グムシオ D.L.
ビリン遺伝子のシスエレメントは、腸の縦軸（陰門）と横軸（十二指腸、盲腸）の限られた領域で発現を制御している。
J. Biol. Chem. 2002; 277: 33275-33283
論文で見る
スコープス (600)
パブコメ
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
エル・マルジューF.
ヤンセン K.P.
チャン・B.H.J.
リー M.
ヒンディー V.
チャン L.
ルーバード D.
シャンボン P.
メッツガー D.
ロビーン S.
腸上皮における組織特異的かつ誘導可能なCre媒介組換え。
Genesis. 2004; 39: 186-193
論文で見る
日本
PubMed
クロス
グーグル奨学生
バーカー N.
バン・エスJ.H.
カイパースJ.
クジャラ P.
ファンデンボーンM.
コージンセン M.
ヘーゲバルト A.
コーヴィング J.
ベグテル H．
ピータース P.J.
et al.
マーカー遺伝子Lgr5による小腸と結腸の幹細胞の同定。
Nature. 2007; 449: 1003-1007
論文で見る
筑波大学
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ミケル S．
ルクレールM.
マーティンR.
チェーン F.
ルノワール M.
ラギドー S.
フドー S.
ブリドノー C.
ノーテン T．
ボーエンB.
他。
Faecalibacterium prausnitziiの抗炎症作用に関連する代謝シグネチャーの同定。
mBio. 2015; 6: 1-10
論文で見る
スコープス (187)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
カトナ I.M.
アーバン・ジュニア、J.F.
シェール I．
カネロプロス-ランジュバンC.
フィンケルマン F.D.
Nippostrongylus brasiliensisによるマウスのIgE反応の誘導：細胞質内IgEまたは表面IgEを有するリンパ球の特性化。
J. Immunol. 1983; 130: 350-356
論文で見る
PubMed
クロスフィルム
グーグル奨学生
アーバンJ.F.
ノーベン-トラウトN.
ドナルドソン D.D.
マデン K.B.
モリス S.C.
コリンズ M．
フィンケルマン F.D.
IL-13, IL-4Rα, Stat6が消化管内線虫Nippostrongylus brasiliensisの駆除に必要である。
Immunity. 1998; 8: 255-264
論文で見る
スコパス (501)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
フィンケルマンF.
モリス S.
オレホバ T.
Sehy D.
マウスにおけるサイトカイン産生測定のためのin vivoサイトカインキャプチャーアッセイ。
Curr. Protoc. Immunol. 2003；第6章（ユニット6.28）
論文で見る
グーグル奨学生
フィンケルマン F.D.
モリス S.C.
マウスにおけるin vivoサイトカイン産生測定法の開発。
Int. Immunol. 1999; 11: 1811-1818
論文で見る
スコープス (95)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ワッデル A.
バランスJ.E.
フンメルA.
アレンガットT.
ローゼン M.J.
IL-33は自然リンパ球IL-13分泌を介して間接的にマウス腸管小胞細胞の分化を誘導する。
J. Immunol. 2018; 202: 598-607
論文で見る
スコープス (56)
クロスリファレンス
グーグル奨学生
ヴァンドゥッセン K.L.
マリンショーJ.M.
シャイフ N.
ミヨシ・エイチ
ムーン C.
ター P.I.
シオルバ M.A.
スタッペンベック T.S.
患者ベースのアッセイを容易にするための強化型ヒト消化管上皮培養系の開発。
Gut. 2015; 64: 911-920
論文で見る
スコープス (348)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
ウー V.
エシュルマン E.M.
橋本-ヒルS.
ウィット J.
ウー S.E.
エングルマン L.
ライス T.
カーンズ R.
クオールズ J.E.
ハスラム D.B.
ら
腸管感染に対する宿主の防御を促す分節化糸状菌由来のレチノイン酸。
Cell Host Microbe. 2021; 29: 1744-1756.e5
論文で見る
(33件)
PubMed
要旨
全文
全文PDF
グーグル奨学生
He L.
プロダンM.A.I.
Yuan F.
Yin X.
Lorkiewicz P.K.
ウェイ X.
フェン・W.
McClain C.
Zhang X.
ガスクロマトグラフィー質量分析法による直鎖および分岐鎖短鎖脂肪酸の同時定量。
J. Chromatogr. B Analyt. Technol. Biomed. 生命科学 2018; 1092: 359-367
論文で見る
スコープス (44)
PubMed
クロス
グーグル奨学生
論文情報
出版履歴
出版 2024年1月30日
受理 受理：2024年1月5日
改訂版受理 2023年10月14日
受理：2023年10月14日 受理日：2023年2月28日
出版段階
インプレス、修正校正
識別
DOI: https://doi.org/10.1016/j.immuni.2024.01.002

著作権
© 2024 Elsevier Inc.
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