ほとんど英語力のない私が「仮面アメリカ」の英文を解釈してみました。
　元のWebコミックはこちらです。

”The Florida Flork-ape" Ambushed me at our hotel room in Orlando, then vanished.

• 「vanished」の主語は前の文と同じで省略されていると解釈すると、「then」以降は完全な文だから、副詞節。

• 【フロリダ フローク エイプは、オーランドのホテルの部屋で我々を待ち伏せし、そして消えた。】→【フロリダ フローク 猿…。ヤツは、オーランドのホテルの部屋でうちらを待ち伏せし、で、消えた…】

Whatever your secrets are, I'll get to the bottom of them!

• 複合関係副詞「whatever」が文頭に出ているから、譲歩の副詞節で、「Whatever」はbe動詞の補語。

• 「get to the bottom of ～」は「～の真相を掴む」の熟語。

• 【お前の秘密がなんであれ、真相を掴んでやるわ】→【お前の正体がなんであれ、曝いてみせるわ！】