作中に登場するキーワードやモチーフを自分なりに解釈したものを並べてみました。あくまでも個人的な解釈ですので、不正確なものや矛盾するものもあると思いますがご容赦ください。

水

羊水。「胎児」である少女は主にこれを飲み、またそこにおしっこをする。「夢」の世界（＝少女にとっての「子宮」または「羊膜」）の中に満たされており、彼女を「外界の干渉」から守るもの。少年は「少女の夢」の世界（＝『子宮」）の住人ではないので、これを飲まない。
ラストの洪水は「破水」すなわち「夢の世界＝子宮」から少女が出ていく（目覚めて独立した一個人となる）ことの象徴か。

瓶

子宮、または羊膜。中に「水（＝羊水）」を満たし、少女を「外界」と隔絶して守るもの。故に少女は「水（＝羊水）」を満たした「瓶（＝子宮）」から周りを見、「水（＝羊水）」を満たした「瓶（＝子宮）」を自分のねぐらである「方舟」に並べて自分を守ろうとする。

ワイン

（経）血、転じて「性的に成熟した女性」の象徴。自身の性的成熟を望まない少女にとっては不要なもの。

ジャム

臍帯血？「胎児」である少女にとっては直接の栄養源。

方舟

未来への希望、種の存続の願い。しかし化石だらけである（＝乗せてきたであろう動物が死滅している）ことから、未来に対する絶望・拒絶・無関心の象徴となっている。
その最奥で無数の「瓶（＝子宮）」の「水（＝羊水）」に守られて寝起きする少女は、パンドラの箱と化した方舟に残された最後の希望ということか。

街

「瓶（＝子宮）」「水（＝羊水）」「ジャム（＝臍帯血）」「ワイン（＝経血）」があり、少女の生命を支える場所。しかし「漁師（＝男性の性欲）」によって度々破壊される存在でもあることから、少女を養う「母」または「年長の女性（たち）」の象徴か。

魚

富・幸・生命力の象徴、転じて「欲を煽るもの」。
しかし実物はこの「（夢の）世界」には存在せず、捕まえることもできず「幸・生命力」をもたらすこともない。

漁師

「魚」を求めてその影に向かって銛を投げ、「街」を破壊する、コミュニケーションのできない存在。「欲」に突き動かされる「男性（の暴力性、性欲）」の象徴か。

窓

処女膜。これが割られることは「破瓜」を意味するか。
作中に登場する「窓」の中の部屋は、その多くが女性のものらしい調度となっていること、少女が見上げるアングルによくなることから、少女から見た「年長の女性」の象徴でもあるのか。

戦車

「街（＝少女を養う年長の女性たち？）」に砲身を向けて進み、いつでも「街」を壊そうとしているように見える存在。漁師同様「男性（の暴力性・性欲）」の象徴か。

少年

少女と同じく人間の姿であり、「漁師」とは異なりコミュニケーションの取れる存在。「男（異性）」という概念ではなく、対話できる個性・精神性を持った他者。

風

「外界（＝神）」からの干渉、「目覚めよ」と呼ぶ声か。

鳥（天使）

「神」の伝令。化石となっていることから、「神の意志（与えられた使命・運命）に対する少女の拒絶を表すか。
この場合の「神の意志（与えられた使命）」とは「他者（異性）と交わって世界を再生すること」であり、これを拒絶するのは「人間の世界の再生＝他者との交流がある世界」への消極的な否定ということになるか。

崖

「少女の夢の世界＝子宮」の出口、すなわち産道。少年を追いかけてこれを越えようとしたということは、少女は「何も考えないし傷つかない（胎児の）自分」であることよりも、「少年（他者）と交わる喜び」を選んだということであり、「他者との交流のある世界（＝新しい物語）」を生み出す決意につながるか。

卵

可能性・未来の象徴

少女の持つ「卵」

自分が生んだわけではないが「鳥（＝天使＝神の使い＝少女自身が一度は拒んだもの）」が宿っていると少女が信じて常に持ち歩くもの。求められる使命の放棄・外界への無関心。中身はおそらく「成熟した（新たな「世界」を生み出す）少女自身」。
少女本人にとっては「他人に壊されては困る」が「孵化されても困る」存在でもあるので常に持ち歩いているのではないか。
少年は「中身」が「少女自身」であることを察してはいるが、中身を少女自身の口から聞き、「鳥」の死亡（＝少女が「神の伝令」を拒絶したこと）が確定するまでは手を出さない。少女が「卵と少女と少年の未来」について口にしたことで、少女の精神が「夢から覚めるのに十分なだけの希望を持っている」ことを確信するも、それを壊して（破瓜を迎えさせて「新しい物語」を孕ませることで）少女を目覚めさせることには最後まで葛藤していたか。

少女の産んだ「卵」

「新しい物語（人間同士が交わる世界）」の象徴。他者（＝少年）と交わることで孕み、生まれたもの。膣からではなく口からの呼気として発生したということは、生物としてではなく「言葉を中心としたコミュニケーション（理性や知性の交流）」で発生する「物語」の世界の始まりか。
本能（「神」が与えた「産めよ増やせよ地に満ちよ」という使命）に殉じる肉体の交わりによって続く世界ではなく、各人が己の意思によって他者と精神的に交わって生み出す「物語」のための「世界」を生んだ？