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https://note.com/cain_covid のサブnoteです。SARS-CoV-2 スパイク部位を分析している論文を中心に日本語訳だけで再編集しています。

  • スパイク部位

    SARS-CoV-2 スパイク部位に関する論文

SARS-CoV-2 スパイクたんぱく質について（概要）

自分なりのまとめ スパイクの全体像NTD部位詳細な役割は未だ不明です。 RBM部位RBDの中でもACE2に接する部分。ACE2との結合性はSARS-CoV-2の感染力に影響する。 フーリン部位予めヒトのフーリンによって切断されている部位。S1とS2が剥がれやすいくなる要因にもなっている（SARS-CoV-1は持ってない部分）。 S2部位SARS-CoV-2がヒト細胞に融合するためのパーツ。SARS-CoV-1と大きな違いはない。SARS-CoV-2内での変異も少ない。

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    • 膜融合後スパイクのクライオ電子顕微鏡構造(2023年6月)

      Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 postfusion spike in membraneSARS-CoV-2 膜融合後スパイクのクライオ電子顕微鏡構造 元→Cryo-EM structure of SARS-CoV-2 postfusion spike in membrane | Nature AbstractSARS-CoV-2 が宿主細胞に侵入するには、ウイルスにコードされたスパイクタンパク質が、切断後に準安定となる融合前構造から、エネ

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      • Sタンパク質のN末端ドメイン変異は、SARS-CoV-2株のエピトープ認識に構造的に関与(2021年10月)

        N-terminal domain mutations of the spike protein are structurally implicated in epitope recognition in emerging SARS-CoV-2 strainsスパイクタンパク質のN末端ドメイン変異は、新興SARS-CoV-2株のエピトープ認識に構造的に関与している。 元→N-terminal domain mutations of the spike protein are

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        • SARS-CoV-2の細胞侵入のメカニズム(2021年10月)

          Mechanisms of SARS-CoV-2 entry into cellsSARS-CoV-2の細胞侵入のメカニズム 元→Mechanisms of SARS-CoV-2 entry into cells | Nature Reviews Molecular Cell Biology Abstract SARS-CoV-2 の感染によって引き起こされた、COVID-19パンデミックによる前例のない公衆衛生と経済への影響に対し、同様に前例のない科学的対応が行われてい

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        SARS-CoV-2 スパイクたんぱく質について（概要）

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        • 膜融合後スパイクのクライオ電子顕微鏡構造(2023年6月)

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        • Sタンパク質のN末端ドメイン変異は、SARS-CoV-2株のエピトープ認識に構造的に関与(2021年10月)

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        • SARS-CoV-2の細胞侵入のメカニズム(2021年10月)

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        マガジン

        • スパイク部位
          16本

        記事

          ウイルス進化中に変化するRBDにおける突然変異の制約シフト(2022年7月)

          元→Shifting mutational constraints in the SARS-CoV-2 receptor-binding domain during viral evolution | Science Shifting mutational constraints in the SARS-CoV-2 receptor-binding domain during viral evolutionウイルス進化中に変化するSARS-CoV-2受容体結合ドメインの突然

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          ウイルス進化中に変化するRBDにおける突然変異の制約シフト(2022年7月)

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          RBD455-456上の XBB系統の収束進化は抗体回避とACE2結合を相乗的に強化(2023年8月)

          Convergent evolution of SARS-CoV-2 XBB lineages on receptor-binding domain 455-456 synergistically enhances antibody evasion and ACE2 binding受容体結合ドメイン455-456上のSARS-CoV-2 XBB系統の収束進化は抗体回避とACE2結合を相乗的に強化する 元→Convergent evolution of SARS-CoV-2

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          RBD455-456上の XBB系統の収束進化は抗体回避とACE2結合を相乗的に強化(2023年8月)

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          Vero細胞適応株は、フリンを介した効率的なスパイク切断によりウイルス増殖の増加を示す(2024年2月)

          Vero cell-adapted SARS-CoV-2 strain shows increased viral growth through furin-mediated efficient spike cleavageVero細胞に適応した SARS-CoV-2 株は、フリンを介した効率的なスパイク切断によりウイルス増殖の増加を示す 元→Vero cell-adapted SARS-CoV-2 strain shows increased viral growth t

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          Vero細胞適応株は、フリンを介した効率的なスパイク切断によりウイルス増殖の増加を示す(2024年2月)

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          XBB株のスパイク構造、立体構造、抗原性、および受容体認識(2024年3月)

          SARS-CoV-2 Omicron XBB lineage spike structures, conformations, antigenicity, and receptor recognitionSARS-CoV-2 Omicron XBB 系統のスパイク構造、立体構造、抗原性、および受容体認識 元→SARS-CoV-2 Omicron XBB lineage spike structures, conformations, antigenicity, and re

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          XBB株のスパイク構造、立体構造、抗原性、および受容体認識(2024年3月)

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          RBD 構造およびVOC間の共受容体結合における N343 グリコシル化の役割(2023年12月)

          #GotGlycans: Role of N343 Glycosylation on the SARS-CoV-2 S RBD Structure and Co-Receptor Binding Across Variants of Concern#GotGlycans: SARS-CoV-2 S RBD 構造における N343 グリコシル化の役割と懸念される変異体間の共受容体結合 元→#GotGlycans: Role of N343 Glycosylation on t

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          RBD 構造およびVOC間の共受容体結合における N343 グリコシル化の役割(2023年12月)

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          オミクロン株の機能喪失変異は、スパイクタンパク質の発現を減少させ、SARS-CoV-2感染を軽減(2023年7月)

          Loss-of-function mutation in Omicron variants reduces spike protein expression and attenuates SARS-CoV-2 infectionオミクロン株の機能喪失変異は、スパイクタンパク質の発現を減少させ、SARS-CoV-2感染を軽減します 元→Loss-of-function mutation in Omicron variants reduces spike protein exp

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          オミクロン株の機能喪失変異は、スパイクタンパク質の発現を減少させ、SARS-CoV-2感染を軽減(2023年7月)

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          スパイク糖タンパク質の進化における構造ダイナミクス(2023年3月)

          Structural dynamics in the evolution of SARS-CoV-2 spike glycoproteinSARS-CoV-2 スパイク糖タンパク質の進化における構造ダイナミクス 元→Structural dynamics in the evolution of SARS-CoV-2 spike glycoprotein | Nature Communications Abstract SARS-CoV-2 スパイク糖タンパク質は、受容体

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          スパイク糖タンパク質の進化における構造ダイナミクス(2023年3月)

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          オミクロン株スパイクの構造的多様性（2022年1月）

          Structural diversity of the SARS-CoV-2 Omicron spikeSARS-CoV-2オミクロンスパイクの構造的多様性 元→Structural diversity of the SARS-CoV-2 Omicron spike (biorxiv.org) Abstract 広範なスパイクタンパク質の変異に助けられて、SARS-CoV-2オミクロン株は以前は優勢だったデルタ株を追い越しました。 スパイクコンフォメーションは、受容体結

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          オミクロン株スパイクの構造的多様性（2022年1月）

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          オミクロン株は、ヒトの初代鼻上皮培養物中で急速な複製を示し、エンドソームの侵入経路を効率的に利用（2021年12月）

          ※2022年5月に version.2 投稿。 The SARS-CoV-2 variant, Omicron, shows rapid replication in human primary nasal epithelial cultures and efficiently uses the endosomal route of entry.SARS-CoV-2 の変異体であるオミクロンは、ヒトの初代鼻上皮培養物中で急速な複製を示し、エンドソームの侵入経路を効率的に利用

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          オミクロン株は、ヒトの初代鼻上皮培養物中で急速な複製を示し、エンドソームの侵入経路を効率的に利用（2021年12月）

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          インドでの感染に関連する B.1.617 は、フューリンによるスパイク開裂の強化を示す（2021年5月）

          The SARS-CoV-2 variants associated with infections in India, B.1.617, show enhanced spike cleavage by furinインドでの感染に関連する SARS-CoV-2 の亜種、B.1.617 は、フューリンによるスパイク開裂の強化を示しています。 元→45859119 (biorxiv.org) Abstract 2019 年に出現した SARS-CoV-2 ウイルスのスパイク

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          インドでの感染に関連する B.1.617 は、フューリンによるスパイク開裂の強化を示す（2021年5月）

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          スパイクタンパク質は合胞体媒介リンパ球除去を決定（2021年4月）

          SARS-CoV-2 spike protein dictates syncytium-mediated lymphocyte eliminationSARS-CoV-2 スパイクタンパク質は合胞体媒介リンパ球除去を決定する 元→https://www.nature.com/articles/s41418-021-00782-3.pdf Abstract 重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）ウイルスは伝染性が高く、リンパ球減少症を引き起こしますが

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          スパイクタンパク質は合胞体媒介リンパ球除去を決定（2021年4月）

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          SARS-CoV-2 ウイルスの分子構造（2020年10月）

          Molecular Architecture of the SARS-CoV-2 VirusSARS-CoV-2 ウイルスの分子構造 元→https://www.cell.com/action/showPdf?pii=S0092-8674%2820%2931159-4 SUMMARY SARS-CoV-2は、COVID-19パンデミックの原因となるエンベロープウイルスです。 SARS-CoV-2タンパク質の構造解明における最近の進歩にもかかわらず、無傷のウイルスの詳細な

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          SARS-CoV-2 ウイルスの分子構造（2020年10月）

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